基因页：SLC9A2

概括？
基因 6549
象征 SLC9A2
同义词 NHE2
描述 Solute Carrier家族9成员A2
参考 MIM：600530|HGNC：HGNC：11072|Ensembl：ENSG00000115616|HPRD：02756|Vega：Otthumg00000130778
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q11.2
Pascal P值 0.003

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0004

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NPTXR 0.79 0.65
FAM120A 0.75 0.75
trim9 0.75 0.77
Stim1 0.75 0.78
C2CD2L 0.75 0.76
SLC8A2 0.75 0.65
SLC25A22 0.75 0.71
otud7a 0.74 0.77
iqsec2 0.74 0.69
WSCD2 0.74 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM36A -0.40 -0.42
C8orf59 -0.39 -0.46
RP9P -0.38 -0.50
C21orf57 -0.38 -0.43
RPL31 -0.37 -0.48
NDUFAF2 -0.37 -0.40
FABP7 -0.36 -0.42
PFDN5 -0.35 -0.42
RPL24 -0.35 -0.46
RPL35 -0.35 -0.46

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015385 钠：氢气活性 塔斯 7683411
GO：0015299 溶质：氢气活性 IEA -
GO：0015297 抗植物活性 IEA -
GO：0031402 钠离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0008104 蛋白质定位 IEA -
去：0006814 钠离子运输 IEA -
去：0006811 离子运输 IEA -
去：0006885 pH的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 塔斯 7683411

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng IL22信号传导DN 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌BRCA1 DN 44 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 264 270 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-130/301 1123 1130 1A，M8 HSA-MIR-130A脑 cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b脑 Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-182 1708年 1714年 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-19 1122 1128 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-26 277 283 1a HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-495 1139 1145 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-96 1707年 1714年 1A，M8 HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc