概括
基因 6553
象征 SLC9A5
同义词 NHE5
描述 Solute Carrier家族9成员A5
参考 MIM:600477|HGNC:HGNC:11078|ENSEMBL:ENSG00000135740|HPRD:02723|Vega:Otthumg00000172935
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q22.1
Pascal P值 0.021
Sherlock P值 0.722
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17572651 CHR1 218943612 SLC9A5 6553 0.17 反式
RS16829545 CHR2 151977407 SLC9A5 6553 1.148E-6 反式
RS3845734 CHR2 171125572 SLC9A5 6553 0.11 反式
RS7584986 CHR2 184111432 SLC9A5 6553 0 反式
RS17762315 CHR5 76807576 SLC9A5 6553 9.123E-4 反式
RS7729096 CHR5 76835927 SLC9A5 6553 0.15 反式
RS1368303 CHR5 147672388 SLC9A5 6553 0.12 反式
RS7020639 Chr9 71907868 SLC9A5 6553 0 反式
RS16955618 CHR15 29937543 SLC9A5 6553 1.155e-11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NUP93 0.77 0.84
disp1 0.75 0.78
CXXC4 0.75 0.76
HCN3 0.75 0.84
PCDHB18 0.74 0.83
ZCCHC8 0.74 0.83
C1orf187 0.74 0.84
Edaradd 0.74 0.77
vav2 0.73 0.84
棕榈 0.73 0.67
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.58 -0.73
AIFM3 -0.57 -0.70
TSC22D4 -0.56 -0.72
FBXO2 -0.56 -0.64
S100B -0.55 -0.76
aldoc -0.55 -0.64
C5orf53 -0.55 -0.70
克鲁 -0.55 -0.65
hepn1 -0.55 -0.68
AF347015.27 -0.54 -0.78

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因