基因页:SLC9A5
概括?
基因 | 6553 |
象征 | SLC9A5 |
同义词 | NHE5 |
描述 | Solute Carrier家族9成员A5 |
参考 | MIM:600477|HGNC:HGNC:11078|ENSEMBL:ENSG00000135740|HPRD:02723|Vega:Otthumg00000172935 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q22.1 |
Pascal P值 | 0.021 |
Sherlock P值 | 0.722 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17572651 | CHR1 | 218943612 | SLC9A5 | 6553 | 0.17 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | SLC9A5 | 6553 | 1.148E-6 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | SLC9A5 | 6553 | 0.11 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | SLC9A5 | 6553 | 0 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | SLC9A5 | 6553 | 9.123E-4 | 反式 | ||
RS7729096 | CHR5 | 76835927 | SLC9A5 | 6553 | 0.15 | 反式 | ||
RS1368303 | CHR5 | 147672388 | SLC9A5 | 6553 | 0.12 | 反式 | ||
RS7020639 | Chr9 | 71907868 | SLC9A5 | 6553 | 0 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | SLC9A5 | 6553 | 1.155e-11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC9A5_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NUP93 | 0.77 | 0.84 |
disp1 | 0.75 | 0.78 |
CXXC4 | 0.75 | 0.76 |
HCN3 | 0.75 | 0.84 |
PCDHB18 | 0.74 | 0.83 |
ZCCHC8 | 0.74 | 0.83 |
C1orf187 | 0.74 | 0.84 |
Edaradd | 0.74 | 0.77 |
vav2 | 0.73 | 0.84 |
棕榈 | 0.73 | 0.67 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.58 | -0.73 |
AIFM3 | -0.57 | -0.70 |
TSC22D4 | -0.56 | -0.72 |
FBXO2 | -0.56 | -0.64 |
S100B | -0.55 | -0.76 |
aldoc | -0.55 | -0.64 |
C5orf53 | -0.55 | -0.70 |
克鲁 | -0.55 | -0.65 |
hepn1 | -0.55 | -0.68 |
AF347015.27 | -0.54 | -0.78 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |