概括
基因 6565
象征 SLC15A2
同义词 pept2
描述 Solute Carrier家族15成员2
参考 MIM:602339|HGNC:HGNC:10921|ENSEMBL:ENSG00000163406|HPRD:09088|Vega:Otthumg00000159423
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q13.33
Pascal P值 0.026
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.77

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11582961 CHR1 184023058 SLC15A2 6565 0.03 反式
RS6732990 CHR2 7471731 SLC15A2 6565 0.08 反式
RS6736892 CHR2 7496871 SLC15A2 6565 0.06 反式
RS6543402 CHR2 106891142 SLC15A2 6565 0.2 反式
RS10180415 CHR2 106891168 SLC15A2 6565 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
hnrnph1 0.96 0.95
0.96 0.96
CBX1 0.96 0.94
SMC3 0.95 0.91
DHX9 0.95 0.94
hnrnpd 0.95 0.94
hnrnpr 0.95 0.95
HMGB3 0.94 0.92
合并 0.94 0.94
Stag1 0.94 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.71 -0.81
C5orf53 -0.71 -0.78
AIFM3 -0.69 -0.79
pth1r -0.69 -0.78
AF347015.31 -0.69 -0.86
FXYD1 -0.69 -0.89
TSC22D4 -0.68 -0.82
MT-CO2 -0.68 -0.87
tinagl1 -0.67 -0.78
aldoc -0.67 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 16738539
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
GO:0015333 肽:氢分类者活性 塔斯 7756356
GO:0015334 高亲和力寡肽转运蛋白活性 IEA -
GO:0015293 分类者活动 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006857 寡肽运输 IEA -
GO:0015893 药物运输 nas 16738539
去:0015031 蛋白质运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005624 膜分数 IEA -
去:0016020 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 7756356

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标DN 124 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chesler Brain QTL顺式 75 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu IL4信号传导 94 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Smarca4目标 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
durchdewald皮肤致癌 88 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUILLETTE CLL 13Q14删除 74 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN 57 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 DN 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应15 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因