基因页:SLC15A2
概括?
基因 | 6565 |
象征 | SLC15A2 |
同义词 | pept2 |
描述 | Solute Carrier家族15成员2 |
参考 | MIM:602339|HGNC:HGNC:10921|ENSEMBL:ENSG00000163406|HPRD:09088|Vega:Otthumg00000159423 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q13.33 |
Pascal P值 | 0.026 |
主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.77 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11582961 | CHR1 | 184023058 | SLC15A2 | 6565 | 0.03 | 反式 | ||
RS6732990 | CHR2 | 7471731 | SLC15A2 | 6565 | 0.08 | 反式 | ||
RS6736892 | CHR2 | 7496871 | SLC15A2 | 6565 | 0.06 | 反式 | ||
RS6543402 | CHR2 | 106891142 | SLC15A2 | 6565 | 0.2 | 反式 | ||
RS10180415 | CHR2 | 106891168 | SLC15A2 | 6565 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC15A2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
hnrnph1 | 0.96 | 0.95 |
放 | 0.96 | 0.96 |
CBX1 | 0.96 | 0.94 |
SMC3 | 0.95 | 0.91 |
DHX9 | 0.95 | 0.94 |
hnrnpd | 0.95 | 0.94 |
hnrnpr | 0.95 | 0.95 |
HMGB3 | 0.94 | 0.92 |
合并 | 0.94 | 0.94 |
Stag1 | 0.94 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.71 | -0.81 |
C5orf53 | -0.71 | -0.78 |
AIFM3 | -0.69 | -0.79 |
pth1r | -0.69 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.86 |
FXYD1 | -0.69 | -0.89 |
TSC22D4 | -0.68 | -0.82 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.87 |
tinagl1 | -0.67 | -0.78 |
aldoc | -0.67 | -0.73 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16738539 | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
GO:0015333 | 肽:氢分类者活性 | 塔斯 | 7756356 | |
GO:0015334 | 高亲和力寡肽转运蛋白活性 | IEA | - | |
GO:0015293 | 分类者活动 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006857 | 寡肽运输 | IEA | - | |
GO:0015893 | 药物运输 | nas | 16738539 | |
去:0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 7756356 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 | 94 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标DN | 124 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chesler Brain QTL顺式 | 75 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu IL4信号传导 | 94 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Smarca4目标 | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
durchdewald皮肤致癌 | 88 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUILLETTE CLL 13Q14删除 | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克拉斯的iwanaga致癌作用 | 170 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 | 111 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN | 57 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 DN | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应15 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |