基因页：SLC18A1
概括？
| 基因 | 6570 |
| 象征 | SLC18A1 |
| 同义词 | CGAT | VAT1 | VMAT1 |
| 描述 | Solute Carrier家族18成员A1 |
| 参考 | MIM：193002|HGNC：HGNC：10934|Ensembl：ENSG0000000036565|HPRD：01897|Vega：Otthumg0000000097017 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8p21.3 |
| Pascal P值 | 0.838 |
| 胎儿β | -0.049 |
| 支持 | 神经递质代谢 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ADT：SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 简历：Phewas | 全球整个关联研究（PHEWAS） | 157个与精神分裂症相关的SNP | 0 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.00057 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.03086 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：Phewas
简历：Phewas| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LRRC51 | 0.72 | 0.52 |
| CCDC74A | 0.69 | 0.48 |
| TCTN1 | 0.69 | 0.55 |
| CCDC74B | 0.67 | 0.51 |
| C9orf24 | 0.67 | 0.53 |
| PPOX | 0.67 | 0.65 |
| C9orf116 | 0.66 | 0.43 |
| C1orf194 | 0.65 | 0.53 |
| FAM181A | 0.64 | 0.39 |
| C9orf9 | 0.64 | 0.54 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| prkg2 | -0.31 | -0.32 |
| CDKL5 | -0.31 | -0.26 |
| LMBRD2 | -0.31 | -0.27 |
| JHDM1D | -0.31 | -0.28 |
| TRIM44 | -0.30 | -0.36 |
| FBXW7 | -0.29 | -0.26 |
| pclo | -0.29 | -0.22 |
| AP000758.2 | -0.29 | -0.27 |
| USP12 | -0.28 | -0.28 |
| KIAA1462 | -0.28 | -0.38 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0008504 | 单胺跨膜转运蛋白活性 | 塔斯 | 8643547 | |
| GO：0015238 | 药物转运蛋白活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0015844 | 单胺运输 | 塔斯 | 8643547 | |
| GO：0015893 | 药物运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005624 | 膜分数 | nas | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO：0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - | |
| 去：0030659 | 细胞质囊泡膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg帕金森氏病 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Na Cl依赖性神经递质转运蛋白 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胺化合物SLC转运蛋白 | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 障碍结肠癌复发 | 42 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoegerkorp CD44靶向时间DN | 25 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由HPV31 UP永生 | 84 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向 | 139 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |