基因页：SLC18A2

概括？
基因 6571
象征 SLC18A2
同义词 SVAT | SVMT | VAT2 | VMAT2
描述 Solute Carrier家族18成员A2成员
参考 MIM：193001|HGNC：HGNC：10935|ENSEMBL：ENSG00000165646|HPRD：01896|Vega：Otthumg0000000019121
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10Q25
Pascal P值 0.667
胎儿β 0.357
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
支持 神经递质代谢

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
ADT：SUN_2012 系统研究抗精神病药及其靶标 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：Gulsuner_2013 整个外显子组测序分析 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
SLC18A2 Chr10 119001268 一个 C NM_003054 p.22i> l 错过 精神分裂症 DNM：Gulsuner_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7095278 10 119025290 SLC18A2 ENSG00000165646.7 1.00458E-6 0.02 24686 gtex_brain_ba24
RS7099216 10 119025462 SLC18A2 ENSG00000165646.7 6.98011E-7 0.02 24858 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ARMCX1 0.95 0.95
CCT6A 0.95 0.96
KLHL7 0.94 0.95
CCT2 0.93 0.96
TCP1 0.93 0.95
polr2b 0.93 0.94
zufsp 0.93 0.92
GDI2 0.93 0.94
MATR3 0.93 0.92
ACTR3 0.93 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.73 -0.84
MT-CO2 -0.70 -0.85
AF347015.33 -0.70 -0.85
FXYD1 -0.70 -0.87
TSC22D4 -0.69 -0.82
AF347015.31 -0.69 -0.83
AF347015.27 -0.69 -0.83
hepn1 -0.69 -0.78
AIFM3 -0.69 -0.79
ifi27 -0.69 -0.85

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005215 转运蛋白活性 IEA -
去：0008504 单胺跨膜转运蛋白活性 塔斯 8095030
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015844 单胺运输 塔斯 8095030
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005624 膜分数 塔斯 8095030
去：0016020 膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 8095030
GO：0031410 细胞质囊泡 IEA -
去：0030659 细胞质囊泡膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Kegg帕金森氏病 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经递质释放周期 34 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组多巴胺神经递质释放周期 11 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组去甲肾上腺素神经递质释放周期 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 89 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Na Cl依赖性神经递质转运蛋白 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胺化合物SLC转运蛋白 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄端癌DN 82 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Pons标记 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng环境压力反应不是旧的4NQO 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng环境压力反应不是紫外线 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng环境应力反应DN 21 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-142-5p 214 220 M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-381 195 201 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-505 206 213 1A，M8 HSA-MIR-505 gucaacuugcugguuccuc