概括
基因 6578
象征 SLCO2A1
同义词 matr1 | oatp2a1 | pgt | phoar2 | slc21a2
描述 溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员2A1
参考 MIM:601460|HGNC:HGNC:10955|ENSEMBL:ENSG00000174640|HPRD:03269|Vega:Otthumg00000159745
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q21
Pascal P值 0.004
Sherlock P值 0.792
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1440176 CHR1 112643779 SLCO2A1 6578 0.03 反式
RS13395192 CHR2 12776302 SLCO2A1 6578 0.07 反式
RS6756986 CHR2 97881266 SLCO2A1 6578 0.01 反式
RS4630919 CHR3 2082448 SLCO2A1 6578 0.13 反式
RS2625966 CHR3 129267056 SLCO2A1 6578 0.01 反式
RS2640017 CHR3 141335120 SLCO2A1 6578 0.04 反式
RS9917710 CHR3 176280218 SLCO2A1 6578 0.08 反式
RS12516216 CHR5 61092624 SLCO2A1 6578 0.01 反式
RS17081113 CHR6 151637449 SLCO2A1 6578 0.19 反式
RS17124783 CHR8 17395794 SLCO2A1 6578 0.12 反式
RS16904143 CHR8 130702810 SLCO2A1 6578 0.08 反式
RS11186481 Chr10 82419692 SLCO2A1 6578 0.19 反式
RS11607762 Chr11 69051044 SLCO2A1 6578 0.1 反式
RS4514621 CHR15 52583152 SLCO2A1 6578 0.01 反式
RS16961083 CHR16 13170784 SLCO2A1 6578 0.16 反式
RS281608 CHR16 34326380 SLCO2A1 6578 0.15 反式
SNP_A-4223854 0 SLCO2A1 6578 0.01 反式
RS4891482 CHR18 70366897 SLCO2A1 6578 0.01 反式
RS17086279 CHR18 70410202 SLCO2A1 6578 0.03 反式
RS11796450 Chrx 3983128 SLCO2A1 6578 2.558E-6 反式
RS16978802 Chrx 3998040 SLCO2A1 6578 2.558E-6 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MON1A 0.87 0.87
imp3 0.87 0.86
RNF126 0.86 0.88
GPS1 0.85 0.84
C11orf68 0.85 0.85
GNB1L 0.85 0.87
TMEM180 0.85 0.84
IRF2BP1 0.84 0.86
MRPS2 0.84 0.83
C1orf70 0.84 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.8 -0.68 -0.68
MT-CO2 -0.66 -0.66
AF347015.27 -0.66 -0.69
AF347015.31 -0.66 -0.65
AF347015.33 -0.66 -0.67
mt-cyb -0.66 -0.67
AF347015.15 -0.64 -0.66
AF347015.26 -0.64 -0.66
AF347015.21 -0.64 -0.66
AF347015.2 -0.64 -0.65

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维生素核苷和相关分子的反应组转运 31 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有机阴离子的反应组传输 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗伊伤口血管向上 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZIRN维甲酸响应 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Saenz排毒途径和致癌DN 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN 74 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14相关 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤预后 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
糖尿病性肾病 86 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggins他莫昔芬抗性 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA受伽马辐射损伤 81 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因