基因页:SLCO2A1
概括?
基因 | 6578 |
象征 | SLCO2A1 |
同义词 | matr1 | oatp2a1 | pgt | phoar2 | slc21a2 |
描述 | 溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员2A1 |
参考 | MIM:601460|HGNC:HGNC:10955|ENSEMBL:ENSG00000174640|HPRD:03269|Vega:Otthumg00000159745 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q21 |
Pascal P值 | 0.004 |
Sherlock P值 | 0.792 |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1440176 | CHR1 | 112643779 | SLCO2A1 | 6578 | 0.03 | 反式 | ||
RS13395192 | CHR2 | 12776302 | SLCO2A1 | 6578 | 0.07 | 反式 | ||
RS6756986 | CHR2 | 97881266 | SLCO2A1 | 6578 | 0.01 | 反式 | ||
RS4630919 | CHR3 | 2082448 | SLCO2A1 | 6578 | 0.13 | 反式 | ||
RS2625966 | CHR3 | 129267056 | SLCO2A1 | 6578 | 0.01 | 反式 | ||
RS2640017 | CHR3 | 141335120 | SLCO2A1 | 6578 | 0.04 | 反式 | ||
RS9917710 | CHR3 | 176280218 | SLCO2A1 | 6578 | 0.08 | 反式 | ||
RS12516216 | CHR5 | 61092624 | SLCO2A1 | 6578 | 0.01 | 反式 | ||
RS17081113 | CHR6 | 151637449 | SLCO2A1 | 6578 | 0.19 | 反式 | ||
RS17124783 | CHR8 | 17395794 | SLCO2A1 | 6578 | 0.12 | 反式 | ||
RS16904143 | CHR8 | 130702810 | SLCO2A1 | 6578 | 0.08 | 反式 | ||
RS11186481 | Chr10 | 82419692 | SLCO2A1 | 6578 | 0.19 | 反式 | ||
RS11607762 | Chr11 | 69051044 | SLCO2A1 | 6578 | 0.1 | 反式 | ||
RS4514621 | CHR15 | 52583152 | SLCO2A1 | 6578 | 0.01 | 反式 | ||
RS16961083 | CHR16 | 13170784 | SLCO2A1 | 6578 | 0.16 | 反式 | ||
RS281608 | CHR16 | 34326380 | SLCO2A1 | 6578 | 0.15 | 反式 | ||
SNP_A-4223854 | 0 | SLCO2A1 | 6578 | 0.01 | 反式 | |||
RS4891482 | CHR18 | 70366897 | SLCO2A1 | 6578 | 0.01 | 反式 | ||
RS17086279 | CHR18 | 70410202 | SLCO2A1 | 6578 | 0.03 | 反式 | ||
RS11796450 | Chrx | 3983128 | SLCO2A1 | 6578 | 2.558E-6 | 反式 | ||
RS16978802 | Chrx | 3998040 | SLCO2A1 | 6578 | 2.558E-6 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLCO2A1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MON1A | 0.87 | 0.87 |
imp3 | 0.87 | 0.86 |
RNF126 | 0.86 | 0.88 |
GPS1 | 0.85 | 0.84 |
C11orf68 | 0.85 | 0.85 |
GNB1L | 0.85 | 0.87 |
TMEM180 | 0.85 | 0.84 |
IRF2BP1 | 0.84 | 0.86 |
MRPS2 | 0.84 | 0.83 |
C1orf70 | 0.84 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.8 | -0.68 | -0.68 |
MT-CO2 | -0.66 | -0.66 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.69 |
AF347015.31 | -0.66 | -0.65 |
AF347015.33 | -0.66 | -0.67 |
mt-cyb | -0.66 | -0.67 |
AF347015.15 | -0.64 | -0.66 |
AF347015.26 | -0.64 | -0.66 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.66 |
AF347015.2 | -0.64 | -0.65 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
维生素核苷和相关分子的反应组转运 | 31 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
有机阴离子的反应组传输 | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗伊伤口血管向上 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZIRN维甲酸响应 | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Saenz排毒途径和致癌DN | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14相关 | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pomeroy髓母细胞瘤预后 | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
糖尿病性肾病 | 86 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggins他莫昔芬抗性 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA受伽马辐射损伤 | 81 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转化特征dn | 103 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向DN | 148 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |