基因页：BMPR1B
Summary？
| 基因ID | 658 |
| Symbol | BMPR1B |
| 同义词 | ALK-6 | ALK6 | AMDD | BDA1D | BDA2 | CDW293 |
| 描述 | bone morphogenetic protein receptor type 1B |
| 参考 | MIM：603248|HGNC：HGNC：1077|Ensembl：ENSG00000138696|HPRD：04457|Vega：Otthumg00000130991 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4q22-q24 |
| Pascal P值 | 0.004 |
| 胎儿β | -1.213 |
| DMG | 1(#研究) |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 简历：Phewas | 全球整个关联研究（PHEWAS） | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
| DMG：Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 1 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 | |
| 网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献：2.4469 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
简历：Phewas
简历：Phewas| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | Function | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10021303 | 4 | 0 | null | 1.669 | BMPR1B | null |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21746997 | 4 | 95679381 | BMPR1B | 1.96E-4 | -0.007 | 0.155 | DMG：Montano_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ATP5C1 | 0.88 | 0.87 |
| suclg1 | 0.85 | 0.85 |
| myl12b | 0.85 | 0.85 |
| Znhit3 | 0.85 | 0.85 |
| GLRX3 | 0.84 | 0.86 |
| PSMA6 | 0.83 | 0.83 |
| Tomm22 | 0.83 | 0.83 |
| MRPL15 | 0.83 | 0.81 |
| Commd7 | 0.83 | 0.84 |
| PSMB3 | 0.83 | 0.83 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.26 | -0.65 | -0.63 |
| AF347015.2 | -0.64 | -0.60 |
| AF347015.15 | -0.62 | -0.58 |
| AF347015.8 | -0.61 | -0.56 |
| AF347015.18 | -0.60 | -0.59 |
| mt-cyb | -0.60 | -0.57 |
| AF347015.33 | -0.58 | -0.56 |
| MT-CO2 | -0.57 | -0.51 |
| AF347015.27 | -0.57 | -0.56 |
| FAM38A | -0.56 | -0.55 |
第三节。基因本体论注释
| Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
| GO:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| GO:0005025 | 转化生长因子β受体活性，I型 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | 艾达 | 12065756 | |
| GO：0016740 | transferase activity | IEA | - | |
| GO：0030145 | manganese ion binding | IEA | - | |
| GO:0046332 | Smad结合 | 艾达 | 12065756 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
| 去：0001550 | 卵巢积云扩展 | ISS | - | |
| 去：0001501 | 骨骼系统开发 | IMP | 14523231 | |
| 去：0001502 | cartilage condensation | nas | 14523231 | |
| GO:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | 艾达 | 12065756 | |
| 去：0009953 | dorsal/ventral pattern formation | IEA | - | |
| 去：0006954 | 炎症反应 | IEA | - | |
| 去：0042698 | 排卵周期 | ISS | - | |
| 去：0030501 | 骨矿化的阳性调节 | IMP | 18436533 | |
| 去：0030509 | BMP信号通路 | EXP | 15621726 | |
| 去：0030509 | BMP信号通路 | nas | 10051328 | |
| 去：0043010 | 相机型眼睛开发 | IEA | - | |
| GO:0035108 | 肢体形态发生 | IMP | 14523231 | |
| 去：0045669 | positive regulation of osteoblast differentiation | IMP | 18436533 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
| GO：0043235 | receptor complex | 塔斯 | 神经递质（GO期限：4） | 14523231 |
| 去：0005886 | 质膜 | EXP | 17356069 | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 我知道了 | 14523231 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 扶少团团员 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | pubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BMP2 | BMP2A | 骨形态发生蛋白2 | 重构的复合物 | Biogrid | 10712517 |
| BMP2 | BMP2A | 骨形态发生蛋白2 | - | HPRD | 9872992 |
| BMP4 | BMP2B |BMP2B1 |MCOPS6 |zyme | 骨形态发生蛋白4 | - | HPRD | 7811286|8702914 |11282024 |
| BMP4 | BMP2B |BMP2B1 |MCOPS6 |zyme | 骨形态发生蛋白4 | 重构的复合物 | Biogrid | 8006002 |
| BMP4 | BMP2B |BMP2B1 |MCOPS6 |zyme | 骨形态发生蛋白4 | BMP4与BMPR1B（BR）相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的BMP4与来自未指定物种的BMPR1B之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15775969 |
| BMP6 | VGR |VGR1 | 骨形态发生蛋白6 | - | HPRD | 10504300|11401330 |
| BMP7 | OP-1 | 骨形态发生蛋白7 | - | HPRD | 8605097 |
| BMP7 | OP-1 | 骨形态发生蛋白7 | 重构的复合物 | Biogrid | 8006002 |
| BMPR1A | 10q23del |ACVRLK3 |ALK3 |CD292 | 骨形态发生蛋白受体，IA型 | - | HPRD，Biogrid | 10712517 |
| BMPR1B | ALK-6 |ALK6 |CDW293 | 骨形态发生蛋白受体，IB型 | - | HPRD，Biogrid | 10712517 |
| BMPR2 | BMPR-II | BMPR3 | BMR2 | BRK-3 | FLJ41585 | FLJ76945 | PPH1 | T-ALK | 骨形态发生蛋白受体，II型（丝氨酸/苏氨酸激酶） | - | HPRD，Biogrid | 10712517 |
| GDF5 | BMP14 |CDMP1 |lap4 |SYNS2 | 生长分化因子5 | 重构的复合物 | Biogrid | 9525338 |
| GDF5 | BMP14 |CDMP1 |lap4 |SYNS2 | 生长分化因子5 | - | HPRD | 11282024 |
| GDF6 | BMP13 |CDMP2 |KFS |KFSL |MGC158100 |MGC158101 |SGM1 | 生长分化因子6 | - | HPRD，Biogrid | 9525338 |
| GDF9 | - | 生长分化因子9 | - | HPRD | 12135884 |
| RAN | ARA24 |GSP1 |TC4 | RAN，RAS成员Ras Oncogene家族 | BMPR1B与RAN相互作用。这种相互作用是在人类BMPR1B和小鼠RAN之间证明的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15761153 |
| SNX6 | MGC3157 |MSTP010 |TFAF2 | 排序Nexin 6 | - | HPRD，Biogrid | 11279102 |