基因页：SLC22A3
概括？
| 基因 | 6581 |
| 象征 | SLC22A3 |
| 同义词 | EMT | Emth | Oct3 |
| 描述 | Solute Carrier家族22成员3 |
| 参考 | MIM：604842|HGNC：HGNC：10967|ENSEMBL：ENSG00000146477|HPRD：05328|Vega：Otthumg0000000015953 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q25.3 |
| Pascal P值 | 0.124 |
| 胎儿β | -0.332 |
| 主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | SLC22A3 | 6581 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| inpp5e | 0.94 | 0.95 |
| PTPN23 | 0.93 | 0.95 |
| setd1a | 0.93 | 0.94 |
| ZNF598 | 0.93 | 0.95 |
| AC145098.2 | 0.93 | 0.93 |
| PPRC1 | 0.93 | 0.95 |
| TSC2 | 0.93 | 0.95 |
| top3b | 0.92 | 0.93 |
| ZNF446 | 0.92 | 0.92 |
| CIZ1 | 0.92 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.77 | -0.82 |
| MT-CO2 | -0.75 | -0.81 |
| AF347015.27 | -0.74 | -0.79 |
| mt-cyb | -0.72 | -0.78 |
| AF347015.33 | -0.72 | -0.76 |
| AF347015.8 | -0.72 | -0.79 |
| AF347015.21 | -0.71 | -0.87 |
| AF347015.15 | -0.69 | -0.75 |
| COPZ2 | -0.69 | -0.74 |
| higd1b | -0.69 | -0.77 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
| GO：0015651 | 季铵基跨膜转运蛋白活性 | 艾达 | 10966924 | |
| GO：0015075 | 离子跨膜转运蛋白活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0051615 | 组胺摄取 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：9） | - |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 去：0015697 | 季铵集团运输 | 艾达 | 10966924 | |
| GO：0015844 | 单胺运输 | IEA | - | |
| 去：0032098 | 食欲的调节 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 9933568 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9933568 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Abacavir Reactome Abacavir运输和代谢 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome有机阳离子阴离子裂解转运 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘普通癌基因 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类未经注释 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组C的UVC响应 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Brideau印迹基因 | 63 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |