基因页:SLC22A2
概括?
基因 | 6582 |
象征 | SLC22A2 |
同义词 | OCT2 |
描述 | Solute Carrier家族22成员2 |
参考 | MIM:602608|HGNC:HGNC:10966|Ensembl:ENSG00000112499|HPRD:04008|Vega:Otthumg0000000015950 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q25.3 |
Pascal P值 | 0.066 |
胎儿β | -0.05 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06236276 | 6 | 160680078 | SLC22A2 | 4.024e-4 | 0.383 | 0.044 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC22A2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CALM3 | 0.90 | 0.91 |
ARF3 | 0.88 | 0.91 |
STX1A | 0.86 | 0.88 |
ptprr | 0.86 | 0.89 |
MOAP1 | 0.86 | 0.87 |
spryd3 | 0.86 | 0.90 |
OXCT1 | 0.85 | 0.85 |
HPCAL4 | 0.85 | 0.86 |
AC073610.6 | 0.84 | 0.87 |
NAP1L5 | 0.83 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SMTN | -0.42 | -0.42 |
透明2 | -0.42 | -0.42 |
Impa2 | -0.40 | -0.44 |
IRF7 | -0.40 | -0.50 |
Bcl7c | -0.39 | -0.45 |
FAM59B | -0.39 | -0.36 |
GRTP1 | -0.39 | -0.39 |
SH2D2A | -0.39 | -0.40 |
SEMA4B | -0.39 | -0.35 |
Rab13 | -0.38 | -0.46 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Abacavir Reactome Abacavir运输和代谢 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经递质释放周期 | 34 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组去甲肾上腺素神经递质释放周期 | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Na Cl依赖性神经递质转运蛋白 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胺化合物SLC转运蛋白 | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有机阳离子阴离子裂解转运 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥多内尔转移 | 82 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BCR ABL1融合的klein目标 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
苏肾 | 15 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Brideau印迹基因 | 63 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |