概括
基因 6582
象征 SLC22A2
同义词 OCT2
描述 Solute Carrier家族22成员2
参考 MIM:602608|HGNC:HGNC:10966|Ensembl:ENSG00000112499|HPRD:04008|Vega:Otthumg0000000015950
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q25.3
Pascal P值 0.066
胎儿β -0.05
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06236276 6 160680078 SLC22A2 4.024e-4 0.383 0.044 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CALM3 0.90 0.91
ARF3 0.88 0.91
STX1A 0.86 0.88
ptprr 0.86 0.89
MOAP1 0.86 0.87
spryd3 0.86 0.90
OXCT1 0.85 0.85
HPCAL4 0.85 0.86
AC073610.6 0.84 0.87
NAP1L5 0.83 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SMTN -0.42 -0.42
透明2 -0.42 -0.42
Impa2 -0.40 -0.44
IRF7 -0.40 -0.50
Bcl7c -0.39 -0.45
FAM59B -0.39 -0.36
GRTP1 -0.39 -0.39
SH2D2A -0.39 -0.40
SEMA4B -0.39 -0.35
Rab13 -0.38 -0.46

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Abacavir Reactome Abacavir运输和代谢 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经递质释放周期 34 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组去甲肾上腺素神经递质释放周期 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 89 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Na Cl依赖性神经递质转运蛋白 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胺化合物SLC转运蛋白 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome有机阳离子阴离子裂解转运 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥多内尔转移 82 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BCR ABL1融合的klein目标 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
苏肾 15 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brideau印迹基因 63 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因