基因页面:SLC22A4
总结吗?
| GeneID | 6583年 |
| 象征 | SLC22A4 |
| 同义词 | OCTN1 |
| 描述 | 溶质载体家庭22个成员4 |
| 参考 | MIM: 604190|HGNC: HGNC: 10968|运用:ENSG00000197208|HPRD: 09171|织女:OTTHUMG00000059648 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5 q31.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.305 |
| 胎儿β | -0.048 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0032 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7147190 | chr14 | 56245823 | SLC22A4 | 6583年 | 0.14 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RDH12 | 0.79 | 0.73 |
| CPNE9 | 0.78 | 0.78 |
| MEI1 | 0.77 | 0.61 |
| TUBA8 | 0.76 | 0.68 |
| GNG13 | 0.76 | 0.46 |
| VWC2 | 0.75 | 0.62 |
| AC010087.3 | 0.74 | 0.80 |
| AL360181.5 | 0.74 | 0.84 |
| TTC39A | 0.73 | 0.61 |
| CLMN | 0.73 | 0.73 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KIAA1949 | -0.48 | -0.69 |
| TUBB2B | -0.48 | -0.72 |
| ZNF551 | -0.47 | -0.70 |
| C19orf57 | -0.47 | -0.61 |
| PCDHB18 | -0.46 | -0.67 |
| ZNF642 | -0.46 | -0.65 |
| CCNG2 | -0.46 | -0.64 |
| AC004017.1 | -0.46 | -0.69 |
| CD24 | -0.46 | -0.62 |
| PLEKHO1 | -0.46 | -0.63 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 助教 | 9426230 | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005215 | 运输活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008513 | 二级活性有机阳离子跨膜转运体活动 | 助教 | 9426230 | |
| 去:0015293 | 同向转运活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0015226 | 肉碱运输活动 | 艾达 | 16729965 | |
| 去:0015075 | 离子跨膜运输活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0031402 | 钠离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0009437 | 肉碱代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007589 | 体液分泌 | 助教 | 9426230 | |
| 去:0006814 | 钠离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006811 | 离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006641 | 三酰甘油代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0015697 | 季铵组运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0015879 | 肉碱运输 | 艾达 | 16729965 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005739 | 线粒体 | 艾达 | 16729965 | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 助教 | 9426230 | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 9426230 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME小分子的跨膜运输 | 413年 | 270年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME SLC介导的跨膜运输 | 241年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME运输的葡萄糖和其他糖胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 | 89年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME有机阳离子阴离子两性离子运输 | 13 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 森古普塔鼻咽癌DN | 349年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 加白血病干细胞DN | 244年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯米尔诺夫循环内皮细胞癌症 | 158年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萨瓦特结直肠腺瘤DN | 291年 | 176年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不知道背景目标2 | 256年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC DN的目标 | 366年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML生存 | 129年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃晚期造血祖 | 544年 | 307年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒20小时DN | 101年 | 70年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒6小时DN | 160年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AMUNDSONγ辐射电阻 | 20. | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 射线能够以ERBB2 CDC25A DN | 159年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| JISON镰状细胞病 | 181年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYAULT肝癌子类G6 | 65年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 蒋介石肝癌CTNNB1子类 | 176年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |