基因页：slit3

Summary？
基因ID 6586
象征 slit3
同义词 megf5 | slil2 | slit1 | slit-3 | slit2
描述 缝隙指导配体3
参考 MIM：603745|HGNC：HGNC：11087|ENSEMBL：ENSG00000184347|HPRD：04775|Vega：Otthumg00000130409
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q35
Pascal P值 0.058
Sherlock P值 0.633
TADA P值 0.025
胎儿β -1.546
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：Gulsuner_2013 整个外显子组测序分析 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 1 链接到Szgene
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.0276
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
slit3 CHR5 168123347 C t NM_001271946
NM_003062		 p.1018c> y
p.1011c> y		 错过
错过		 精神分裂症 DNM：Gulsuner_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6555806 CHR5 167799161 slit3 6586 0.04 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DDX39 0.95 0.89
aaas 0.95 0.90
rnaseh2a 0.94 0.88
IMPDH2 0.94 0.93
Trim28 0.93 0.94
Wrap53 0.93 0.91
Smarcb1 0.93 0.94
拉利 0.93 0.92
MAD2L2 0.93 0.88
BAT1 0.93 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.68 -0.86
AF347015.31 -0.68 -0.85
C5orf53 -0.68 -0.75
MT-CO2 -0.68 -0.86
AF347015.33 -0.67 -0.85
mt-cyb -0.66 -0.84
HLA-F -0.65 -0.73
AF347015.8 -0.65 -0.85
AIFM3 -0.65 -0.72
S100B -0.64 -0.78

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 nas -
去：0005515 蛋白质结合 塔斯 9813312
去：0005198 结构分子活性 nas -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007417 中枢神经系统发展 塔斯 大脑（GO期限：6） 10349621
去：0007411 轴突指导 IEA Axon（GO期限：13） -
去：0009887 器官形态发生 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 塔斯 9813312
去：0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -
去：0005615 细胞外空间 塔斯 9813312

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Netrin1信号传导 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN 90 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Pou5f1目标 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahajan对IL1A DN的反应 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall因TERT DN永生 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
泰勒在急性淋巴细胞白血病中甲基化 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
角色glis3目标 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM糖蛋白 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因