基因页面:SLN
总结吗?
| GeneID | 6588年 |
| 象征 | SLN |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | sarcolipin |
| 参考 | MIM: 602203|HGNC: HGNC: 11089|运用:ENSG00000170290|HPRD: 03729| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q22.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.241 |
| 胎儿β | 1.341 |
| eGene | 小脑半球 小脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4526604 | chr1 | 42182143 | SLN | 6588年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs10158440 | chr1 | 157672303 | SLN | 6588年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs7662675 | chr4 | 2413016 | SLN | 6588年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs4974710 | chr4 | 2414667 | SLN | 6588年 | 0.04 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SNRPC | 0.92 | 0.90 |
| H2AFZ | 0.91 | 0.89 |
| BAT4 | 0.90 | 0.89 |
| PMF1 | 0.89 | 0.88 |
| BOD1 | 0.89 | 0.88 |
| PHB2 | 0.88 | 0.93 |
| DDX39 | 0.88 | 0.85 |
| ABT1 | 0.88 | 0.89 |
| RANBP1 | 0.88 | 0.85 |
| APEX1 | 0.88 | 0.87 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.80 |
| MT-CYB | -0.67 | -0.81 |
| AF347015.26 | -0.67 | -0.83 |
| AF347015.15 | -0.66 | -0.81 |
| AF347015.27 | -0.66 | -0.79 |
| AF347015.8 | -0.66 | -0.80 |
| MT-CO2 | -0.66 | -0.77 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.76 |
| AF347015.2 | -0.64 | -0.78 |
| APOL1 | -0.62 | -0.71 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 去:0030234 | 酶调节活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006810 | 运输 | 助教 | 9367679 | |
| 去:0051924 | 调节钙离子运输 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 助教 | 9367679 | |
| 去:0033017 | 肌浆网膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 图姆收缩期心力衰竭 | 423年 | 283年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李神经嵴干细胞 | 146年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| EBAUER目标PAX3 FOXO1融合起来 | 207年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼头部和颈部癌症F | 54 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KAAB心脏心房和心室 | 249年 | 170年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤H3K27ME3前列腺癌 | 196年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 克罗默肿瘤发生DN | 51 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YAUCH刺猬信号旁分泌DN | 264年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 山中胶质母细胞瘤生存了 | 11 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |