基因页：SMN1
概括？
| 基因 | 6606 |
| 象征 | SMN1 |
| 同义词 | bcd541 | gemin1 | sma | sma1 | sma2 | sma3 | sma4 | sma@| smn | smnt | smnt | t-bcd541 | tdrd16a |
| 描述 | 运动神经元1，端粒的生存 |
| 参考 | MIM：600354|HGNC：HGNC：11117|Ensembl：ENSG00000172062|HPRD：02646|Vega：Otthumg0000000099361 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5q13.2 |
| Sherlock P值 | 0.004 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.1944 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TCF12 | 0.87 | 0.88 |
| Narg2 | 0.86 | 0.84 |
| Haus6 | 0.85 | 0.88 |
| EPB41L5 | 0.84 | 0.81 |
| tulp3 | 0.84 | 0.76 |
| CDO1 | 0.84 | 0.77 |
| TMEM194A | 0.84 | 0.84 |
| DHX40 | 0.83 | 0.85 |
| C6orf167 | 0.83 | 0.82 |
| prkd3 | 0.83 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.54 | -0.74 |
| AF347015.31 | -0.53 | -0.71 |
| FXYD1 | -0.53 | -0.71 |
| ifi27 | -0.51 | -0.70 |
| C5orf53 | -0.51 | -0.63 |
| CXCL14 | -0.51 | -0.72 |
| AF347015.33 | -0.51 | -0.67 |
| AF347015.27 | -0.50 | -0.67 |
| myl3 | -0.50 | -0.70 |
| AF347015.21 | -0.50 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003676 | 核酸结合 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BAT3 | Bag-6 |Bag6 |D6S52E |G3 | HLA-B相关的成绩单3 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| BCL2 | Bcl-2 | B细胞CLL/淋巴瘤2 | - | HPRD，Biogrid | 9389483 |
| C1orf103 | FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 | 染色体1开放阅读框103 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| 线圈 | Cln80 |p80-coilin | 线圈 | - | HPRD，Biogrid | 11641277|12361597 |
| COPS6 | CSN6 |MOV34-34KD | COP9本构型显微类同源物亚基6（拟南芥） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| DDX20 | DKFZP434H052 |DP103 |双子座3 | 死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽20 | - | HPRD，Biogrid | 10601333 |
| DHX9 | ddx9 |LKP |ndhii |RHA | DEAH（ASP-GLU-ALA-HIS）盒多肽9 | - | HPRD，Biogrid | 11149922 |
| fbl | fib |flrn |RNU3IP1 | 纤维林 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共定位 重构的复合物 |
Biogrid | 11509230 |
| FUBP1 | FBP |fubp | 上游元素（保险丝）结合蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 10734235 |
| GAR1 | NOLA1 | GAR1核糖核蛋白同源物（酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11509230 |
| GDF9 | - | 生长分化因子9 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| 双子座4 | DKFZP434B131 |DKFZP434D174 |HC56 |HCAP1 |HHRF-1 |P97 | 宝石（核管细胞器）相关蛋白4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共同分级 共纯化 |
Biogrid | 10942426|12668731 |
| 双子座5 | DKFZP586M1824 |MGC142174 | 宝石（核管细胞器）相关蛋白5 | - | HPRD，Biogrid | 11714716 |
| 双子座6 | FLJ23459 | 宝石（核管细胞器）相关蛋白6 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11748230 |
| 双子座7 | SIP3 | 宝石（核管细胞器）相关蛋白7 | - | HPRD，Biogrid | 12065586 |
| hnrnpr | FLJ25714 |hnrpr |HNRNP-R | 异质核核糖核蛋白R | - | HPRD，Biogrid | 11574476|11773003 |
| KPNB1 | IMB1 |IPOB |impnb |MGC2155 |MGC2156 |MGC2157 |NTF97 | 核桃蛋白（importin）beta 1 | - | HPRD，Biogrid | 12095920 |
| leng8 | KIAA1932 |MGC40108 |PP13842 | 白细胞受体簇（LRC）成员8 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| LGALS1 | DKFZP686E23103 |gal1 |英镑 | 凝集素，半乳糖苷结合，可溶性，1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11522829 |
| LSM1 | CASM |YJL124C | LSM1同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 10851237 |
| LSM11 | FLJ38273 | LSM11，U7小核RNA相关 | - | HPRD | 12975319 |
| LSM2 | C6orf28 |g7b |YBL026W |snrnp | LSM2同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 10851237 |
| LSM3 | smx4 |USS2 |YLR438C | LSM3同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 10851237 |
| LSM4 | yer112w | LSM4同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 10851237 |
| LSM5 | FLJ12710 |yer146w | LSM5同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 10851237 |
| LSM6 | YDR378C | LSM6同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 10851237 |
| LSM7 | YNL147W | LSM7同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 10851237 |
| OSTF1 | FLJ20559 |OSF |SH3P2 |BA235O14.1 | 破骨细胞刺激因子1 | - | HPRD | 11551898 |
| POP7 | 0610037N12RIK |rpp2 |RPP20 | 加工前体7，核糖核酸酶P/MRP亚基（酿酒酵母） | RPP20与SMN相互作用 | 绑定 | 14715275 |
| PPP4C | pp4 |pph3 |ppx | 蛋白质磷酸酶4（以前为X），催化亚基 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12668731 |
| SIP1 | gemin2 |sip1-delta | 运动神经元蛋白相互作用蛋白1的存活率1 | - | HPRD，Biogrid | 9323129 |
| SMN1 | BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 | 运动神经元1，端粒的生存 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| SMN1 | BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 | 运动神经元1，端粒的生存 | HSMN与第二个HSMN分子相互作用。 | 绑定 | 14715275 |
| SMN2 | BCD541 |C-BCD541 |FLJ76644 |MGC20996 |MGC5208 |SMNC | 运动神经元2的存活率，丝粒 | 共同分级 共纯化 |
Biogrid | 10942426 |
| SNRPB | 鳕鱼|SNRPB1 |SMB/SMB'|snrnp-b | 小核核糖核蛋白多肽B和B1 | SMN与SMB'相互作用。 | 绑定 | 15494309 |
| SNRPB | 鳕鱼|SNRPB1 |SMB/SMB'|snrnp-b | 小核核糖核蛋白多肽B和B1 | - | HPRD | 11720283 |
| SNRPB | 鳕鱼|SNRPB1 |SMB/SMB'|snrnp-b | 小核核糖核蛋白多肽B和B1 | - | HPRD，Biogrid | 9323129 | 11720283 |
| SNRPD1 | HST2456 |SMD1 |snrpd | 小核核糖核蛋白D1多肽16KDA | 共同分级 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 9323129|10851237 |10942426 |
| SNRPD2 | SMD2 |SNRPD1 | 小核核糖核蛋白D2多肽16.5KDA | 共同分级 共纯化 |
Biogrid | 10942426 |
| SNRPD3 | SMD3 | 小核核糖核蛋白D3多肽18KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 10851237 |
| snrpe | B-Raf |中小型 | 小核核糖核蛋白多肽E | 重构的复合物 | Biogrid | 9323129 |
| snupn | kpnbl |rnut1 |Snurportin1 | Snurportin 1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12095920 |
| STXBP3 | munc18-3 |munc18c |PSP |UNC-18C | 语法素结合蛋白3 | - | HPRD | 12065586 |
| 合并 | gry-rbp |HNRPQ1 |NSAP1 |RP1-3J17.2 |DJ3J17.2 |HNRNP-Q |pp68 | Synaptotagmin结合，细胞质RNA相互作用蛋白 | - | HPRD | 11773003 |
| TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | - | HPRD，Biogrid | 11704667 |
| UNC119 | HRG4 | UNC-119同源物（秀丽隐杆线虫） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| wdyhv1 | C8orf32 |FLJ10204 | WDYHV主题包含1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| Zranb2 | DKFZP686J1831 |DKFZP686N09117 |FLJ41119 |zis |zis1 |zis2 |ZNF265 | 锌指，持续2个包含2个 | - | HPRD | 11448987 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 非编码RNA的反应组代谢 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 戈德拉斯体内平衡增殖 | 171 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Myc Up监管 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |