基因页面:SMPD1
总结吗?
| GeneID | 6609年 |
| 象征 | SMPD1 |
| 同义词 | ASM | ASMASE | NPD |
| 描述 | 鞘磷脂磷酸二酯酶1 |
| 参考 | MIM: 607608|HGNC: HGNC: 11120|运用:ENSG00000166311|HPRD: 06353|织女:OTTHUMG00000165453 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 p15.4-p15.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.309 |
| 夏洛克假定值 | 0.812 |
| 胎儿β | -0.978 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ADT: Sun_2012 | 系统的抗精神病药物及其目标的调查 | 共有382个药物协会涉及43个抗精神病药物和49目标基因。 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg17121955 | 11 | 6411382 | SMPD1 | 5.146的军医 | -0.222 | 0.047 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs8141327 | chr22 | 48747918 | SMPD1 | 6609年 | 0.04 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 俱乐部 | 0.77 | 0.92 |
| GPR37L1 | 0.77 | 0.92 |
| HLA-E | 0.77 | 0.90 |
| PRODH | 0.76 | 0.91 |
| SLC39A12 | 0.76 | 0.86 |
| HEPN1 | 0.75 | 0.89 |
| GRIN2C | 0.75 | 0.88 |
| SELENBP1 | 0.75 | 0.89 |
| TSC22D4 | 0.74 | 0.89 |
| FAM151A | 0.74 | 0.87 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DUSP12 | -0.63 | -0.82 |
| MLLT11 | -0.62 | -0.79 |
| PARP6 | -0.62 | -0.79 |
| GSTA4 | -0.62 | -0.81 |
| SUPV3L1 | -0.62 | -0.81 |
| PPP3CC | -0.62 | -0.79 |
| STMN1 | -0.61 | -0.80 |
| C9orf30 | -0.61 | -0.80 |
| ZWILCH | -0.61 | -0.78 |
| SPATS2 | -0.61 | -0.79 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004767 | 鞘磷脂磷酸二酯酶活性 | 助教 | 1718266 | |
| 去:0016798 | 水解酶活性,作用于糖基的债券 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | 助教 | 神经突(术语层面:5) | 7670466 |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 7670466 | |
| 去:0008152 | 代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006685 | 鞘磷脂分解过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005764 | 溶酶体 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG鞘脂类代谢 | 40 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG溶酶体 | 121年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA神经酰胺通路 | 22 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA EDG1通路 | 27 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 圣FAS信号通路 | 65年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID小道途径 | 28 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID FAS通路 | 38 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID TNF通路 | 46 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID IL2 PI3K通路 | 34 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID神经酰胺通路 | 48 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME鞘糖脂代谢 | 38 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME磷脂代谢 | 198年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME鞘脂类代谢 | 69年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名1 | 380年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名2 | 418年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ENK紫外线反应角化细胞 | 530年 | 342年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3滑落紫外线反应 | 309年 | 199年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRUETZMANN胰腺癌DN | 203年 | 134年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 弗里德曼衰老了 | 77年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 | 398年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FRASOR应对雌二醇DN | 82年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 詹多发性骨髓瘤起来 | 64年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃长期造血干细胞 | 302年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARIADASON应对姜黄素苏灵大5 | 23 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佐藤在胰腺癌1被甲基化 | 419年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCCOLLUM GELDANAMYCIN抵抗了 | 10 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伯纳德PPAPDC1B目标了 | 40 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精子 | 114年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究包括 | 420年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 60张及目标的人力资源 | 293年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村脂肪形成晚了 | 104年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 国外RB1目标融合性的 | 567年 | 365年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔法诺MYC目标 | 239年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |