基因页：snapc2
概括？
| 基因 | 6618 |
| 象征 | snapc2 |
| 同义词 | ptfdelta | snap45 |
| 描述 | 小核RNA激活复合物多肽2 |
| 参考 | MIM：605076|HGNC：HGNC：11135|Ensembl：ENSG00000104976|HPRD：05464|Vega：Otthumg00000182456 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19p13 |
| Pascal P值 | 0.046 |
| Sherlock P值 | 0.446 |
| 胎儿β | -0.241 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08550729 | 19 | 7987986 | snapc2 | 5.116E-4 | 0.375 | 0.047 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4497566 | CHR13 | 51694324 | snapc2 | 6618 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| EOMES | 0.88 | 0.56 |
| NHLH1 | 0.87 | 0.41 |
| TFAP2C | 0.86 | 0.56 |
| DMRTA2 | 0.86 | 0.51 |
| GPC4 | 0.85 | 0.50 |
| LRIG3 | 0.84 | 0.48 |
| vim | 0.83 | 0.60 |
| Col4a6 | 0.82 | 0.59 |
| itga2 | 0.82 | 0.38 |
| FZD8 | 0.82 | 0.63 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.32 | -0.37 |
| asphd1 | -0.32 | -0.28 |
| CCNI2 | -0.32 | -0.39 |
| LGI4 | -0.32 | -0.04 |
| HLA-F | -0.32 | -0.25 |
| FBXO2 | -0.32 | -0.26 |
| ADAP1 | -0.31 | -0.22 |
| pth1r | -0.31 | -0.25 |
| SLC9A3R2 | -0.31 | -0.14 |
| tinagl1 | -0.30 | -0.27 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome RNA Pol III转录 | 33 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol III转录启动来自3型启动子 | 26 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN | 153 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TSAI对电离辐射的响应 | 149 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Medina Smarca4目标 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇12的时间反应12 | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |