概括
基因 6619
象征 SNAPC3
同义词 PTFBETA | SNAP50
描述 小核RNA激活复合物多肽3
参考 MIM:602348|HGNC:HGNC:11136|HPRD:03826|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9p22.3
Pascal P值 1.049E-4
Sherlock P值 0.247
胎儿β 1.213

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NFYA 0.94 0.80
IGSF3 0.94 0.90
Bcl11b 0.90 0.83
USP6NL 0.90 0.88
EPHB1 0.90 0.85
TBR1 0.90 0.72
vangl2 0.90 0.87
AC087698.1 0.89 0.75
IGFBPL1 0.89 0.89
Sox11 0.89 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TNFSF12 -0.59 -0.65
C5orf53 -0.57 -0.85
FBXO2 -0.57 -0.68
pth1r -0.57 -0.69
HLA-F -0.57 -0.82
TMEM54 -0.56 -0.61
C19orf66 -0.56 -0.48
LHPP -0.56 -0.64
serpinb6 -0.56 -0.71
PPAP2A -0.56 -0.62

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome RNA Pol III转录 33 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol III转录启动来自3型启动子 26 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌群集1 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin的反应,没有MGMT 24小时 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin的反应,没有MGMT 48小时 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt的反应48小时 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt的反应24小时 9 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因