基因页:SNAPC3
概括?
基因 | 6619 |
象征 | SNAPC3 |
同义词 | PTFBETA | SNAP50 |
描述 | 小核RNA激活复合物多肽3 |
参考 | MIM:602348|HGNC:HGNC:11136|HPRD:03826| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p22.3 |
Pascal P值 | 1.049E-4 |
Sherlock P值 | 0.247 |
胎儿β | 1.213 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SNAPC3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NFYA | 0.94 | 0.80 |
IGSF3 | 0.94 | 0.90 |
Bcl11b | 0.90 | 0.83 |
USP6NL | 0.90 | 0.88 |
EPHB1 | 0.90 | 0.85 |
TBR1 | 0.90 | 0.72 |
vangl2 | 0.90 | 0.87 |
AC087698.1 | 0.89 | 0.75 |
IGFBPL1 | 0.89 | 0.89 |
Sox11 | 0.89 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TNFSF12 | -0.59 | -0.65 |
C5orf53 | -0.57 | -0.85 |
FBXO2 | -0.57 | -0.68 |
pth1r | -0.57 | -0.69 |
HLA-F | -0.57 | -0.82 |
TMEM54 | -0.56 | -0.61 |
C19orf66 | -0.56 | -0.48 |
LHPP | -0.56 | -0.64 |
serpinb6 | -0.56 | -0.71 |
PPAP2A | -0.56 | -0.62 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome RNA Pol III转录 | 33 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol III转录启动来自3型启动子 | 26 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌群集1 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin的反应,没有MGMT 24小时 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin的反应,没有MGMT 48小时 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt的反应48小时 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt的反应24小时 | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |