基因页：SOD1

概括？
基因 6647
象征 SOD1
同义词 ALS | ALS1 | HEL-S-44 | IPOA | SOD | HSOD1 |同二聚体
描述 超氧化物歧化酶1，可溶性
参考 MIM：147450|HGNC：HGNC：11179|ENSEMBL：ENSG00000142168|HPRD：00937|Vega：Otthumg00000084878
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.11
Pascal P值 0.31
Sherlock P值 0.043
胎儿β -0.452
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：5

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7132043 CHR12 80968399 SOD1 6647 0.2 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
加克 0.89 0.88
arfgap1 0.88 0.86
DNAJC11 0.86 0.83
Cul9 0.86 0.85
PLA2G6 0.86 0.83
ATG2A 0.86 0.85
ZNF839 0.86 0.82
C16orf58 0.85 0.81
DDX51 0.85 0.85
Rab11fip3 0.85 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.78 -0.67
MT-CO2 -0.70 -0.60
AF347015.31 -0.70 -0.61
AF347015.8 -0.67 -0.58
C1orf54 -0.67 -0.62
mt-cyb -0.65 -0.55
clec2b -0.65 -0.60
AF347015.27 -0.64 -0.57
AF347015.33 -0.64 -0.53
鼻孔 -0.63 -0.50

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005507 铜离子结合 艾达 17008312
去：0004784 超氧化物歧化酶活性 艾达 15544046|17324120
去：0008270 锌离子结合 艾达 17381088
GO：0016209 抗氧化活性 IEA -
GO：0016491 氧化还原酶活性 IEA -
GO：0051087 伴侣结合 IPI 9726962
GO：0042803 蛋白质同构化活性 nas 9726962|10837872
GO：0030346 蛋白磷酸酶2b结合 艾达 17324120
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0048678 对轴突损伤的反应 ISS 轴突（GO术语级别：5） -
GO：0019226 神经冲动的传播 ISS 神经元（GO期限：5） -
GO：0043524 神经元细胞凋亡的阴性调节 ISS 神经元（GO期限：9） -
GO：0000187 MAPK活动的激活 ISS -
去：0000303 对超氧化物的反应 艾达 16790527
去：0001541 卵巢卵泡发育 ISS -
去：0002262 髓样细胞稳态 ISS -
去：0001895 视网膜稳态 ISS -
去：0001890 胎盘开发 nas 12485882
去：0001819 细胞因子的阳性调节 艾达 15544046
去：0006302 双链断裂修复 ISS -
去：0006309 凋亡期间的DNA碎片 ISS -
去：0008217 血压调节 ISS -
去：0007283 精子发生 ISS -
去：0009408 对热的反应 ISS -
去：0007626 运动行为 ISS -
去：0007605 声音的感官感知 ISS -
去：0007569 细胞衰老 IEP 15377661
去：0007569 细胞衰老 小鬼 12871978
去：0007566 胚胎植入 ISS -
去：0007566 胚胎植入 nas 10920331
去：0006749 谷胱甘肽代谢过程 ISS -
去：0006879 细胞铁离子稳态 ISS -
去：0043065 凋亡的阳性调节 我知道了 16790527
去：0033081 调控胸腺中T细胞分化 nas 16716898
GO：0042493 对药物的反应 ISS -
GO：0042554 超氧化物释放 IEA -
GO：0032287 周围神经系统中的髓鞘维持 ISS -
GO：0043085 催化活性的阳性调节 艾达 17324120
去：0019430 去除超氧化物自由基 ISS -
GO：0042542 对过氧化氢的反应 ISS -
去：0040014 调节多细胞生物生长 ISS -
GO：0045541 胆固醇生物合成过程的阴性调节 艾达 15473258
GO：0045859 调节蛋白激酶活性 艾达 16254550
去：0050665 过氧化氢生物合成过程 艾达 15544046
去：0050665 过氧化氢生物合成过程 ISS -
去：0046620 器官生长调节 nas 16716898
GO：0046716 肌肉维护 ISS -
GO：0048538 胸腺发育 nas 16716898
去：0060088 听觉受体细胞立体核组织 ISS -
GO：0060087 血管平滑肌的放松 ISS -
GO：0045471 对乙醇的反应 ISS -
GO：0055114 还原氧化 IEA -
GO：0060047 心脏收缩 艾达 9539776
GO：0060052 神经丝细胞骨架组织 ISS -
GO：0051881 线粒体膜电位的调节 小鬼 16790527
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0043025 细胞体 艾达 Axon，Dendrite（GO期限：4） 17324120
GO：0032839 树突细胞质 艾达 树突（GO期限：9） 17324120
去：0005829 细胞质 艾达 16790527
去：0005615 细胞外空间 艾达 7172448|9453566
去：0005634 核 艾达 9726962|17504823
去：0005737 细胞质 艾达 9726962|11527942|17077646
|17504823
去：0005739 线粒体 艾达 16790527
去：0005759 线粒体基质 nas 17008312
去：0005777 过氧化物酶体 nas 15766328
去：0005886 质膜 艾达 17077646|17324120
GO：0031012 细胞外基质 艾达 9699963
GO：0031410 细胞质囊泡 艾达 17077646
GO：0043234 蛋白质复合物 艾达 17324120

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg过氧化物酶体 78 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS 53 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Huntingtons病 185 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Prion疾病 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta自由途径 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta寿命途径 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID时代基因组途径 65 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HNF3A途径 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chandran转移Top50上升 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子 142 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU血管生成DN 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Houstis Ros 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fab M7类型的Ross Aml 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞发育DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL具有VH重排DN 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
takao对UVB辐射的响应 86 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫星对干扰素βdn的响应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张增殖与静止 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
怀特塞德顺铂抗性DN 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Visala对热休克和老化DN的响应 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江式下丘脑老化 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng环境压力反应不是WS中伽马的 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng环境压力反应不是WS中的紫外线 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng环境压力反应 56 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee转移和替代剪接DN 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK排卵前卵泡 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向成纤维细胞 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞DN 76 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-377 107 113 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu