概括
基因 665
象征 BNIP3L
同义词 bnip3a | nix
描述 Bcl2/腺病毒E1B 19KDA相互作用蛋白3类样
参考 MIM:605368|HGNC:HGNC:1085|ENSEMBL:ENSG00000104765|HPRD:07288|Vega:Otthumg0000000099433
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p21
Pascal P值 3.064e-4
Sherlock P值 0.909
胎儿β 0.093
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.00057
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03086

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02464098 8 26240309 BNIP3L 4.22E-5 -0.324 0.021 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17014160 CHR1 206855799 BNIP3L 665 0.03 反式
RS16849258 CHR3 165317775 BNIP3L 665 0.05 反式
RS1199915 0 BNIP3L 665 0.1 反式
RS520325 CHR3 165361016 BNIP3L 665 0.12 反式
RS830202 CHR3 165654796 BNIP3L 665 0.01 反式
RS11953760 CHR5 9842943 BNIP3L 665 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C22ORF28 0.87 0.87
C18orf10 0.86 0.85
VPS45 0.86 0.86
WRB 0.86 0.86
C6orf62 0.86 0.85
0.86 0.85
SMU1 0.86 0.84
RPN1 0.85 0.84
FAF1 0.85 0.85
SEC22A 0.85 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.71 -0.70
AF347015.8 -0.70 -0.70
AF347015.21 -0.69 -0.68
AF347015.33 -0.68 -0.69
AF347015.31 -0.68 -0.68
mt-cyb -0.68 -0.68
AF347015.2 -0.67 -0.69
AF347015.27 -0.67 -0.68
FXYD1 -0.66 -0.71
ifi27 -0.66 -0.72

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005521 层粘连结合 艾达 10381623
GO:0042803 蛋白质同构化活性 艾达 10381623
GO:0046982 蛋白质异二聚化活性 艾达 10381623
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006917 诱导凋亡 艾达 9973195
去:0008634 生存基因产物表达的负调节 艾达 9973195
去:0043065 凋亡的阳性调节 IEA -
去:0043066 凋亡的负调节 艾达 10381623
GO:0051607 对病毒的防御反应 艾达 9973195
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005635 核信封 艾达 10381623
去:0005739 线粒体 艾达 9973195|10381623
去:0005740 线粒体信封 IEA -
去:0005783 内质网 艾达 10381623
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID P53下游途径 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
早期的粉刺开发 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ginestier乳腺癌20q13扩增 119 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bilban b cll lpl up 63 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge Hif1a靶向​​DN 91 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇2 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔卡拉凋亡 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
唱歌转移基质 110 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对高清MTX DN的响应 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iizuka肝癌进展L1 G1 UP 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP 89 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
量缺氧 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA髓样差异化 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金缺氧 25 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对甲氨蝶呤DN的Brachat响应 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈里斯缺氧 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brachat对Camptothecin DN的反应 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng环境压力反应不是WS中伽马的 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng环境压力反应不是紫外线 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng环境压力反应 56 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC目标 153 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨森对促性腺营养蛋白的反应 91 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin的反应 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标3 89 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fardin缺氧11 32 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-133 1290 1296 1a HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua
mir-138 276 283 1A,M8 HSA-MIR-138 Agcugguuguguugaauc
mir-183 2690 2696 M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-23 842 848 1a HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-27 34 40 1a HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-5p 2651 2657 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-320 2339 2345 1a HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-323 1276 1282 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-374 285 291 1a HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-544 1531年 1538年 1A,M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu