基因页：Sox2
概括？
| 基因 | 6657 |
| 象征 | Sox2 |
| 同义词 | anop3 | mcOps3 |
| 描述 | sry-box 2 |
| 参考 | MIM：184429|HGNC：HGNC：11195|Ensembl：ENSG00000181449|HPRD：08921|Vega：Otthumg00000158222 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q26.33 |
| Pascal P值 | 0.082 |
| 胎儿beta | 0.061 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共同表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ENO1 | 0.75 | 0.73 |
| 希巴德 | 0.73 | 0.74 |
| CD59 | 0.73 | 0.75 |
| BTN3A3 | 0.73 | 0.71 |
| CTSF | 0.72 | 0.74 |
| tecr | 0.71 | 0.76 |
| ATPAF1 | 0.71 | 0.75 |
| NR1H2 | 0.71 | 0.79 |
| SDHD | 0.70 | 0.72 |
| anxa7 | 0.70 | 0.73 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ankrd12 | -0.45 | -0.46 |
| RTF1 | -0.45 | -0.45 |
| CCAR1 | -0.44 | -0.49 |
| AC004017.1 | -0.44 | -0.38 |
| FNBP1L | -0.44 | -0.35 |
| ZNF551 | -0.44 | -0.38 |
| PHF14 | -0.44 | -0.46 |
| RBMX2 | -0.43 | -0.48 |
| KIAA1949 | -0.43 | -0.35 |
| AC109829.1 | -0.43 | -0.47 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | nas | 7849401 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
| 去：0001708 | 细胞命运规范 | IEA | - | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | nas | 7849401 | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0006325 | 建立或维护染色质体系结构 | nas | 7849401 | |
| 去：0050973 | 检测与平衡感受有关的机械刺激 | IEA | - | |
| GO：0042472 | 内耳形态发生 | IEA | - | |
| 去：0045944 | RNA聚合酶II启动子的转录正调控 | IEA | - | |
| 去：0050910 | 检测与声音感知有关的机械刺激 | IEA | - | |
| GO：0046148 | 颜料生物合成过程 | IEA | - | |
| 细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | nas | 7849401 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey靶标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nagashima NRG1信号传导DN | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liu CDX2靶向DN | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射4的响应4 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GROSS HIF1A靶向DN | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TCGA胶质母细胞瘤副本编号 | 75 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CERVERA SDHB目标1 DN | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Brocke凋亡由IL6逆转 | 144 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LE EGR2目标 | 108 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Affar YY1的目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McCollum geldanamycin耐药性DN | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LSD1目标 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 克拉斯的iwanaga癌变 | 170 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 康拉德干细胞 | 39 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4Me3和H3K27Me3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML具有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| korkola胚胎癌与精液瘤 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chandran转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| verhaak胶质母细胞瘤的胸膜 | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Duan Prdm5目标 | 79 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A目标 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工型7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 1小时DN信号传导 | 106 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-129-5p | 768 | 774 | M8 | HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc |
| HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcggugggcuugcu | ||||
| HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc | ||||
| HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcggugggcuugcu | ||||
| mir-132/212 | 758 | 764 | 1a | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacggcc |
| HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
| mir-182 | 535 | 541 | M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucacaca |
| MiR-200BC/429 | 477 | 483 | M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguaaaaAccgu | ||||
| mir-21 | 522 | 528 | M8 | HSA-MIR-21脑 | uagcuuaucagaguauguuga |
| HSA-MIR-590 | gagcuuauucauaaaaagugcag | ||||
| mir-382 | 1055 | 1061 | 1a | HSA-MIR-382脑 | gaaguuucgugguggauucg |
| mir-450 | 768 | 774 | 1a | HSA-MIR-450 | uuuuugcgauguuccuaaua |
| HSA-MIR-450 | uuuuugcgauguuccuaaua | ||||
| mir-493-5p | 659 | 665 | 1a | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |