基因页面:SOX3
总结吗?
GeneID | 6658年 |
象征 | SOX3 |
同义词 | PHP GHDX | MRGH | | PHPX | SOXB |
描述 | SRY-box 3 |
参考 | MIM: 313430|HGNC: HGNC: 11199|运用:ENSG00000134595|HPRD: 02432|织女:OTTHUMG00000022544 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | Xq27.1 |
胎儿β | 1.318 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SOX3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | 助教 | 8625802 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007417 | 中枢神经系统开发 | 助教 | 大脑(术语层面:6) | 8625802 |
去:0030900 | 前脑发展 | 国际能源机构 | 大脑(术语层面:8) | - - - - - - |
去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0009887 | 器官形态发生 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0048515 | 精细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
李神经嵴干细胞DN | 118年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
道森在淋巴瘤TCL1甲基化 | 59 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德粉碎和燃烧突变DN | 185年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈ETV5目标睾丸 | 23 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗1 | 528年 | 324年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESRRA目标对雌激素的DN | 41 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MASSARWEH三苯氧胺耐药性DN | 258年 | 160年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MATZUK排卵期前的滤泡 | 10 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霍夫曼PRE BI大前BII淋巴细胞DN | 75年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
36张及目标的人力资源 | 221年 | 150年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
斯坦ESR1目标 | 85年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3 UNMETHYLATED | 228年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
姚明时间响应黄体酮集群2 | 86年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
不通过AKT1 BHAT ESR1目标 | 211年 | 131年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
皮德森转移由ERBB2同种型4 | 110年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 493 - 5 - p | 160年 | 166年 | 1 | hsa - mir - 493 - 5 - p | UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU |
mir - 543 | 504年 | 510年 | 1 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |