概括
基因 6664
象征 Sox11
同义词 MRD27
描述 Sry-Box 11
参考 MIM:600898|HGNC:HGNC:11191|ENSEMBL:ENSG00000176887|HPRD:02940|Vega:Otthumg0000000090333
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P25
Pascal P值 0.001
胎儿β 6.165

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 8666406
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合DN 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KHSV miRNA的Samols目标 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 DN 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hummel Burkitts淋巴瘤 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德里乳腺癌预后 50 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨乳腺癌ESR1 DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES核心九相关 100 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB目标 74 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制目标 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙槽横纹肌肉瘤 98 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向DN 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21靶向 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung可卡因奖励4WK 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
拉菲尔Vegfa的目标 9 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性B 38 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 1284 1291 1A,M8 HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-125/351 5225 5231 1a HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug
HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug
mir-128 750 756 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-132/212 6635 6641 M8 HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
HSA-MIR-132 uaacagucuacccaugggg
mir-133 592 598 M8 HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua
mir-137 6253 6260 1A,M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-141/200a 7223 7230 1A,M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-142-3p 5726 5732 M8 HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-142-5p 5074 5080 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-144 1285 1291 1a HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-145 6392 6399 1A,M8 HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-148/152 1496年 1502 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-153 674 680 M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-155 7104 7110 M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-186 4444 4451 1A,M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-196 5728 5735 1A,M8 HSA-MIR-196A uagguaguucauguugugug
HSA-MIR-196B uagguaguucuuguugg
mir-204/211 985 992 1A,M8 HSA-MIR-204 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
HSA-MIR-204 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
HSA-MIR-204 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-217 7220 7226 M8 HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-218 5875 5882 1A,M8 HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-223 756 762 M8 HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-224 759 765 1a HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-23 810 816 M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-25/32/92/363/367 1425 1432 1A,M8 HSA-MIR-25 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-27 6234 6240 1a HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-323 810 816 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-324-3p 5779 5785 1a HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
mir-324-5p 5775 5781 1a HSA-MIR-324-5p CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGU
mir-328 5264 5271 1A,M8 HSA-MIR-328 cuggcccucugccuuccgu
mir-33 1493 1499年 M8 HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-330 4548 4554 M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-376c 7122 7128 1a HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-381 5315 5321 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-383 7144 7150 1a HSA-MIR-383 agaucagaaggugauuguggcu
mir-421 5119 5125 1a HSA-MIR-421 ggccucauaauguuguug
mir-448 4700 4706 M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-455 1396年 1403 1A,M8 HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg
mir-485-3p 7070 7076 M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-490 6818 6824 M8 HSA-MIR-490 caaccuggaggacuaugcugcug
mir-493-5p 725 731 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-499 4256 4262 M8 HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa
mir-539 1414 1420 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-543 4673 4679 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu