基因页面:SP2
总结吗?
| GeneID | 6668年 |
| 象征 | SP2 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | Sp2转录因子 |
| 参考 | MIM: 601801|HGNC: HGNC: 11207|运用:ENSG00000167182|HPRD: 03481|织女:OTTHUMG00000150196 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 17 q21.32 |
| 帕斯卡假定值 | 0.129 |
| 夏洛克假定值 | 0.644 |
| 胎儿β | -0.08 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SP2 | chr17 | 46000639 | C | T | NM_003110 NM_003110 |
。 。 |
沉默 拼接 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg02372393 | 17 | 45973417 | SP2 | 2.38平台以及 | -0.017 | 6.17 e - | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC4A1 | 0.83 | 0.66 |
| EPB42 | 0.78 | 0.65 |
| HEMGN | 0.76 | 0.65 |
| NFE2 | 0.74 | 0.50 |
| ALAS2 | 0.71 | 0.63 |
| GATA1 | 0.69 | 0.43 |
| HBM | 0.68 | 0.53 |
| ERAF | 0.65 | 0.61 |
| NSUN7 | 0.64 | 0.57 |
| HBG1 | 0.62 | 0.60 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.39 | -0.59 |
| AIFM3 | -0.38 | -0.51 |
| HLA-F | -0.37 | -0.52 |
| FBXO2 | -0.37 | -0.52 |
| S100B | -0.37 | -0.55 |
| C1orf151 | -0.36 | -0.46 |
| CA4 | -0.36 | -0.50 |
| FXYD1 | -0.36 | -0.56 |
| PTGDS | -0.36 | -0.49 |
| MT-CO2 | -0.35 | -0.59 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌17 Q25对方篮里扩增子 | 335年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RODWELL老化肾脏没有血液DN | 150年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RODWELL老化肾脏DN | 145年 | 88年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HNE和《魏盖尔氧化应激 | 60 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |