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基因	6688
象征	SPI1
Synonyms	\| pu.1 \| sfpi1 \| spi-1 \| spi-a
Description	Spi-1 proto-oncogene
Reference	MIM：165170\|HGNC：HGNC：11241\|Ensembl:ENSG00000066336\|HPRD:01305\|Vega:OTTHUMG00000150150
基因类型	蛋白质编码
Map location	11p11.2
Pascal p-value	0.01
胎儿β	-0.077
DMG	1(# studies)
主持人	Myers' cis & trans 元

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
CV:GWASdb	Genome-wide Association Studies	精神分裂症的GWASDB记录
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG：Vaneijk_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。	1
go_annotation	将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释	与神经相关的关键字的命中：1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

Differentially methylated gene

Probe	染色体	位置	Nearest gene	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
cg06147863	11	47400113	SPI1	0.001	-5.274		DMG：Vaneijk_2014

eQTL annotation

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	QVALUE	EQTL类型
RS4844714	CHR1	208874118	SPI1	6688	0.18	反式
RS7754123	CHR6	132667231	SPI1	6688	0.03	反式
RS17076272	CHR13	22726361	SPI1	6688	0.02	反式
RS17076274	CHR13	22726381	SPI1	6688	0.02	反式
RS10483856	CHR14	74365294	SPI1	6688	0.12	反式
RS8072151	CHR17	50228268	SPI1	6688	0.11	反式
RS16982879	Chrx	92924110	SPI1	6688	0.09	反式
RS7879274	Chrx	145592957	SPI1	6688	0.07	反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	斯皮尔曼的相关性
PSMA4	0.87	0.87
UTP11L	0.87	0.87
PSMA3	0.87	0.86
C4ORF27	0.87	0.88
EAPP	0.86	0.86
PPHLN1	0.86	0.86
PAK1IP1	0.85	0.85
C6orf162	0.85	0.83
BXDC2	0.85	0.86
DDX50	0.85	0.84

Top 10 negatively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	斯皮尔曼的相关性
AF347015.2	-0.74	-0.70
mt-cyb	-0.73	-0.70
MT-CO2	-0.73	-0.67
AF347015.8	-0.73	-0.68
AF347015.15	-0.72	-0.70
AF347015.26	-0.72	-0.70
AF347015.33	-0.72	-0.68
AF347015.27	-0.70	-0.68
AF347015.31	-0.69	-0.67
AF347015.9	-0.66	-0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0003700	转录factor activity	IEA		-
GO:0003700	转录factor activity	TAS		2180582\|10867017
GO:0003723	RNA结合	IEA		-
去：0005515	蛋白质结合	IPI		10207087
GO：0016563	转录activator activity	IEA		-
GO:0043565	sequence-specific DNA binding	IEA		-
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0043011	myeloid dendritic cell differentiation	IEA	树突（GO期限：10）	-
GO:0000122	RNA聚合酶II启动子的转录负调控	TAS		10867017
去：0006355	调节转录，DNA依赖性的调节	IEA		-
GO:0030098	淋巴细胞分化	IEA		-
去：0006350	转录	IEA		-
GO:0043193	基因特异性转录的阳性调节	IDA		12833137
GO：0030851	粒细胞分化	IEA		-
GO：0030225	macrophage differentiation	IEA		-
GO：0045646	红细胞分化的调节	IMP		12833137
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005634	nucleus	IEA		-

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
ATF1	EWS-ATF1 \| FUS/ATF-1 \| TREB36	activating transcription factor 1	-	HPRD,BioGRID	7730336
宿雾	C/EBP-Alpha \|CEBP	CCAAT/增强子结合蛋白（C/EBP），α	-	HPRD,BioGRID	12091339
CEBPB	C/EBP-beta \| CRP2 \| IL6DBP \| LAP \| MGC32080 \| NF-IL6 \| TCF5	CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta	-	HPRD,BioGRID	7594592
Cebpe	C/EBP-EPSILON \|CRP1	CCAAT/增强子结合蛋白（C/EBP），Epsilon	C/EBP-epsilon interacts with PU.1.	绑定	12202480
克莱姆	ICER \|MGC111110 \|MGC17881 \|MGC41893 \|HCREM-2	营地响应元件调节器	-	HPRD,BioGRID	7730336
CSNK2A1	CK2A1 \| CKII	酪蛋白激酶2，α1多肽	生化活动	Biogrid	8632909
尔格	ERG-3 \|p55	V-ETS红细胞增生病毒E26癌基因同源物（Avian）	-	HPRD	9681824
ETS1	ETS-1 \|ewsr2 \|FLJ10768	V-ETS红细胞增生病毒E26癌基因同源1（Avian）	重构的复合物	Biogrid	9681824
ETS2	ETS2IT1	V-ETS红细胞增生病毒E26癌基因同源2（Avian）	重构的复合物	Biogrid	9681824
ETV1	DKFZp781L0674 \| ER81 \| MGC104699 \| MGC120533 \| MGC120534	ets variant 1	重构的复合物	Biogrid	9681824
fos	AP-1 \|c-fos	v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因homolog	重构的复合物	Biogrid	9681824
FUS	切碎\|FUS-CHOP \|fus1 \|TLS \|TLS/CHOP \|HNRNP-P2	fusion (involved in t(12;16) in malignant liposarcoma)	-	HPRD,BioGRID	9478924
GATA1	ERYF1 \| GF-1 \| GF1 \| NFE1	GATA结合蛋白1（球蛋白转录因子1）	PU.1与GATA-1相互作用。	绑定	12202480
GATA2	MGC2306 \|NFE1B	GATA binding protein 2	-	HPRD,BioGRID	10411939
IRF4	LSIRF \| MUM1	interferon regulatory factor 4	-	HPRD,BioGRID	10022840\|12372320
IRF8	H-ICSBP \| ICSBP \| ICSBP1 \| IRF-8	interferon regulatory factor 8	-	HPRD	10734131
六月	AP-1 \|AP1 \|C-Jun	jun oncogene	重构的复合物	Biogrid	9681824
六月	AP-1 \|AP1 \|C-Jun	jun oncogene	-	HPRD	12091339
MAPK8	jnk \|JNK1 \|JNK1A2 \|JNK21B1/2 \|prkm8 \|SAPK1	有丝分裂原激活的蛋白激酶8	生化活动	Biogrid	8632909
mitf	mi \|WS2A \|Bhlhe32	微粒细胞相关的转录因子	-	HPRD,BioGRID	9918847
NFKB1	DKFZP686C01211 \|EBP-1 \|kbf1 \|MGC54151 \|nf-kappa-b \|NFKB-P105 \|NFKB-P50 \|P105	B细胞中Kappa光多肽基因增强子的核因子1	-	HPRD	9094628
NFYA	CBF-A \|CBF-B \|FLJ11236 \|hap2 \|nf-ya	核转录因子y，alpha	重构的复合物	Biogrid	9668064
NONO	NMT55 \|NRB54 \|p54 \|p54nrb	non-POU domain containing, octamer-binding	-	HPRD,BioGRID	8626664
PRG2	BMPG \| MBP \| MBP1 \| MGC14537	蛋白聚糖2，骨髓（天然杀伤细胞活化剂，嗜酸性粒细胞颗粒主要碱性蛋白）	MBP-P2启动子与PU.1相互作用。	绑定	12202480
刺	SPI-B	SPI-B转录因子（SPI-1/PU.1相关）	-	HPRD,BioGRID	10196196

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
癌症中的KEGG途径	328	259	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg急性髓样白血病	60	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID IL4 2PATHWAY	65	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID REG GR PATHWAY	82	60	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID CMYB途径	84	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID MYC REPRESS PATHWAY	63	52	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID RB 1PATHWAY	65	46	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS UP	579	346	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标	473	314	All SZGR 2.0 genes in this pathway
OSMAN BLADDER CANCER UP	404	246	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 UP	380	236	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 UP	418	263	All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标	187	115	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARKEY RB1 CHRONIC LOF DN	118	78	All SZGR 2.0 genes in this pathway
roversi神经胶质瘤副本编号	100	75	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jazag TGFB1通过SMAD4 DN发出信号	66	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络	1442	892	All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼转移DN	261	155	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shin B细胞淋巴瘤簇8	36	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bonome卵巢癌的生存次优秀	510	309	All SZGR 2.0 genes in this pathway
公园APL发病机理DN	50	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PARK TRETINOIN RESPONSE AND PML RARA FUSION	30	21	All SZGR 2.0 genes in this pathway
公园维甲酸响应和RARA PLZF融合	22	14	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK	1210	725	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHAN EARLY DIFFERENTIATION GENES DN	42	29	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CROONQUIST NRAS VS STROMAL STIMULATION UP	41	26	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3	174	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN	68	45	All SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine乳头状甲状腺癌DN	80	53	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3	142	80	All SZGR 2.0 genes in this pathway
由PML Rara Fusion绑定的Martens	456	287	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHYLA CBFA2T3靶向	387	225	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1	344	215	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Huang Gata2靶向	149	96	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	Target position			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
miR-155	46	53	1A，M8	HSA-MIR-155	UUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGG
mir-339	73	79	1a	hsa-miR-339	ucccuccuccaggagcuca

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

Gene Page:SPI1