基因页:spr
概括?
基因 | 6697 |
象征 | spr |
同义词 | SDR38C1 |
描述 | Sepiapterin还原酶(7,8-二氢生物蛋白:NADP+氧化还原酶) |
参考 | MIM:182125|HGNC:HGNC:11257|Ensembl:ENSG00000116096|HPRD:01632|Vega:Otthumg00000129777 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P14-P12 |
Pascal P值 | 0.011 |
胎儿β | -1.433 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17022908 | CHR2 | 38783057 | spr | 6697 | 0.13 | 反式 | ||
RS7607798 | CHR2 | 102043108 | spr | 6697 | 0.13 | 反式 | ||
RS10178499 | CHR2 | 127937434 | spr | 6697 | 0.17 | 反式 | ||
RS2461463 | CHR2 | 128708062 | spr | 6697 | 0.07 | 反式 | ||
RS1397611 | CHR4 | 120225347 | spr | 6697 | 0.16 | 反式 | ||
RS11722940 | CHR4 | 120233215 | spr | 6697 | 0.13 | 反式 | ||
RS17595790 | CHR4 | 120276219 | spr | 6697 | 0.12 | 反式 | ||
RS7706288 | CHR5 | 141864248 | spr | 6697 | 0 | 反式 | ||
RS1898661 | CHR5 | 153338309 | spr | 6697 | 0.12 | 反式 | ||
RS11996557 | CHR8 | 102901392 | spr | 6697 | 0.15 | 反式 | ||
RS16868715 | CHR8 | 102922408 | spr | 6697 | 0.08 | 反式 | ||
RS10739219 | Chr9 | 108938328 | spr | 6697 | 0.18 | 反式 | ||
RS10980452 | Chr9 | 113332327 | spr | 6697 | 0.14 | 反式 | ||
RS6478513 | Chr9 | 124238226 | spr | 6697 | 0.11 | 反式 | ||
RS17152865 | Chr10 | 13171768 | spr | 6697 | 0.04 | 反式 | ||
SNP_A-2055321 | 0 | spr | 6697 | 0.17 | 反式 | |||
RS11030327 | Chr11 | 3956554 | spr | 6697 | 0.07 | 反式 | ||
RS17007452 | CHR12 | 81243404 | spr | 6697 | 0.01 | 反式 | ||
RS3899870 | CHR13 | 97205717 | spr | 6697 | 0.02 | 反式 | ||
RS9300361 | CHR13 | 97210272 | spr | 6697 | 0.14 | 反式 | ||
RS3784005 | CHR14 | 76077230 | spr | 6697 | 0.05 | 反式 | ||
RS17757723 | CHR14 | 79323591 | spr | 6697 | 0.06 | 反式 | ||
RS2829739 | CHR21 | 26791883 | spr | 6697 | 0.06 | 反式 | ||
RS216780 | CHR21 | 27324318 | spr | 6697 | 0.16 | 反式 | ||
RS2829996 | CHR21 | 27326755 | spr | 6697 | 0.06 | 反式 | ||
RS1001022 | CHR22 | 26403487 | spr | 6697 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SPR_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TAP1 | 0.72 | 0.47 |
IRF9 | 0.71 | 0.43 |
MX1 | 0.70 | 0.40 |
ifit3 | 0.70 | 0.38 |
ifitm3 | 0.70 | 0.35 |
SP110 | 0.69 | 0.54 |
ifit1 | 0.69 | 0.31 |
PLSCR1 | 0.69 | 0.45 |
ifi44l | 0.69 | 0.46 |
PARP9 | 0.68 | 0.52 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
OR2W3 | -0.35 | -0.38 |
PRRT2 | -0.35 | -0.37 |
PKNOX2 | -0.35 | -0.36 |
LRRC4C | -0.35 | -0.38 |
slitrk5 | -0.35 | -0.36 |
CSMD1 | -0.34 | -0.36 |
KIAA1239 | -0.34 | -0.40 |
mylip | -0.34 | -0.38 |
Arpp-21 | -0.34 | -0.38 |
CHD5 | -0.34 | -0.36 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg叶酸生物合成 | 11 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome四氢无菌蛋白BH4合成回收的挽救和调节 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Enos激活和调节 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射3的响应3 | 48 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN | 98 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Takeer吉西他滨抗性DN | 122 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |