概括
基因 6697
象征 spr
同义词 SDR38C1
描述 Sepiapterin还原酶(7,8-二氢生物蛋白:NADP+氧化还原酶)
参考 MIM:182125|HGNC:HGNC:11257|Ensembl:ENSG00000116096|HPRD:01632|Vega:Otthumg00000129777
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P14-P12
Pascal P值 0.011
胎儿β -1.433
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17022908 CHR2 38783057 spr 6697 0.13 反式
RS7607798 CHR2 102043108 spr 6697 0.13 反式
RS10178499 CHR2 127937434 spr 6697 0.17 反式
RS2461463 CHR2 128708062 spr 6697 0.07 反式
RS1397611 CHR4 120225347 spr 6697 0.16 反式
RS11722940 CHR4 120233215 spr 6697 0.13 反式
RS17595790 CHR4 120276219 spr 6697 0.12 反式
RS7706288 CHR5 141864248 spr 6697 0 反式
RS1898661 CHR5 153338309 spr 6697 0.12 反式
RS11996557 CHR8 102901392 spr 6697 0.15 反式
RS16868715 CHR8 102922408 spr 6697 0.08 反式
RS10739219 Chr9 108938328 spr 6697 0.18 反式
RS10980452 Chr9 113332327 spr 6697 0.14 反式
RS6478513 Chr9 124238226 spr 6697 0.11 反式
RS17152865 Chr10 13171768 spr 6697 0.04 反式
SNP_A-2055321 0 spr 6697 0.17 反式
RS11030327 Chr11 3956554 spr 6697 0.07 反式
RS17007452 CHR12 81243404 spr 6697 0.01 反式
RS3899870 CHR13 97205717 spr 6697 0.02 反式
RS9300361 CHR13 97210272 spr 6697 0.14 反式
RS3784005 CHR14 76077230 spr 6697 0.05 反式
RS17757723 CHR14 79323591 spr 6697 0.06 反式
RS2829739 CHR21 26791883 spr 6697 0.06 反式
RS216780 CHR21 27324318 spr 6697 0.16 反式
RS2829996 CHR21 27326755 spr 6697 0.06 反式
RS1001022 CHR22 26403487 spr 6697 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TAP1 0.72 0.47
IRF9 0.71 0.43
MX1 0.70 0.40
ifit3 0.70 0.38
ifitm3 0.70 0.35
SP110 0.69 0.54
ifit1 0.69 0.31
PLSCR1 0.69 0.45
ifi44l 0.69 0.46
PARP9 0.68 0.52
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
OR2W3 -0.35 -0.38
PRRT2 -0.35 -0.37
PKNOX2 -0.35 -0.36
LRRC4C -0.35 -0.38
slitrk5 -0.35 -0.36
CSMD1 -0.34 -0.36
KIAA1239 -0.34 -0.40
mylip -0.34 -0.38
Arpp-21 -0.34 -0.38
CHD5 -0.34 -0.36

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg叶酸生物合成 11 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome四氢无菌蛋白BH4合成回收的挽救和调节 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Enos激活和调节 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射3的响应3 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN 98 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takeer吉西他滨抗性DN 122 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因