基因页：sprr3
概括？
| 基因 | 6707 |
| 象征 | sprr3 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 富含脯氨酸的小蛋白3 |
| 参考 | MIM：182271|HGNC：HGNC：11268|Ensembl：ENSG00000163209|HPRD：01652|Vega：Otthumg0000000013872 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21-Q22 |
| 胎儿β | 0.097 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21543102 | 1 | 152974771 | sprr3 | 2.762E-4 | -0.298 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6902183 | CHR6 | 121963786 | sprr3 | 6707 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CNIH | 0.75 | 0.72 |
| GLRX3 | 0.73 | 0.72 |
| Stard3nl | 0.71 | 0.72 |
| FAM103A1 | 0.70 | 0.68 |
| MRPL15 | 0.70 | 0.65 |
| suclg1 | 0.70 | 0.66 |
| BBS4 | 0.70 | 0.74 |
| ARMC10 | 0.70 | 0.70 |
| MRPS35 | 0.70 | 0.74 |
| C20ORF111 | 0.69 | 0.71 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.8 | -0.45 | -0.52 |
| MT-ATP8 | -0.44 | -0.50 |
| AF347015.18 | -0.44 | -0.55 |
| AC100783.1 | -0.43 | -0.56 |
| C10orf108 | -0.43 | -0.48 |
| AF347015.15 | -0.43 | -0.50 |
| AF347015.26 | -0.43 | -0.50 |
| AF347015.27 | -0.42 | -0.49 |
| mt-cyb | -0.42 | -0.49 |
| AC016705.1 | -0.41 | -0.56 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10510474 | |
| 去：0005198 | 结构分子活性 | 塔斯 | 9889002 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008544 | 表皮发展 | nas | 8325635 | |
| GO：0042060 | 伤口愈合 | 塔斯 | 10510474 | |
| 去：0030216 | 角质形成细胞分化 | nas | 8325635 | |
| GO：0031424 | 角质化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN | 175 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liu CDX2靶向DN | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Barretts食道DN | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林被肿瘤微环境沉默 | 108 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Coulouarn暂时TGFB1签名 | 109 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO上皮分化模块 | 69 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |