概括
基因 671
象征 BPI
同义词 BPIFD1 | RBPI
描述 杀菌/渗透率蛋白
参考 MIM:109195|HGNC:HGNC:1095|ENSEMBL:ENSG00000101425|HPRD:00174|Vega:Otthumg0000000032441
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q11.23
Pascal P值 0.733
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18493415 20 36931157 BPI 3.701E-4 0.439 0.043 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Brip1 0.97 0.76
MCM10 0.97 0.79
KIF15 0.96 0.80
地狱 0.96 0.80
法奇 0.96 0.72
ASPM 0.96 0.80
top2a 0.96 0.82
CKAP2L 0.96 0.77
KIF14 0.96 0.78
KIF23 0.96 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO2 -0.42 -0.70
SLC9A3R2 -0.41 -0.52
LHPP -0.41 -0.64
HLA-F -0.41 -0.70
C5orf53 -0.41 -0.66
asphd1 -0.41 -0.63
pth1r -0.40 -0.67
TNFSF12 -0.40 -0.66
AIFM3 -0.40 -0.66
aldoc -0.39 -0.66

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 142 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AML1 MTG8融合的Dunne目标 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标2小时 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内利未成熟的中性粒细胞 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌晚期复发DN 69 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因