基因页：SPTB
概括？
| 基因 | 6710 |
| 象征 | SPTB |
| 同义词 | EL3 | HS2 | HSPTB1 | SPH2 |
| 描述 | 光谱β，红细胞 |
| 参考 | MIM：182870|HGNC：HGNC：11274|ENSEMBL：ENSG00000070182|HPRD：01686|Vega：Otthumg00000171550 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 14Q23.3 |
| Pascal P值 | 0.619 |
| 胎儿β | -1.514 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 结构可塑性 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG10937593 | 14 | 65290063 | SPTB | 3.796E-4 | -0.339 | 0.043 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | SPTB | 6710 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KIF12 | 0.81 | 0.71 |
| CRHBP | 0.80 | 0.84 |
| TAC3 | 0.78 | 0.80 |
| matk | 0.78 | 0.73 |
| ST6GALNAC6 | 0.78 | 0.74 |
| CAMK1 | 0.77 | 0.77 |
| HSD11B1L | 0.76 | 0.75 |
| FAM98C | 0.76 | 0.74 |
| DHDH | 0.76 | 0.80 |
| ppm1m | 0.74 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MAP4K4 | -0.40 | -0.34 |
| AC005035.1 | -0.38 | -0.32 |
| EIF5B | -0.38 | -0.43 |
| FRMD4B | -0.37 | -0.25 |
| ZNF652 | -0.37 | -0.26 |
| mllt3 | -0.36 | -0.10 |
| AF186192.1 | -0.36 | -0.26 |
| RNF182 | -0.36 | -0.30 |
| ldlr | -0.36 | -0.33 |
| GJC1 | -0.36 | -0.30 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome NCAM信号传导，用于神经突的生长 | 64 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome L1CAM相互作用 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| L1和氨基链蛋白之间的反应组相互作用 | 23 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌良好生存A4 | 196 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集7 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gregory合成致死与伊马替尼 | 145 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斯坦纳红细胞膜基因 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |