基因页：SREBF1

概括？
基因 6720
象征 SREBF1
同义词 SREBP-1C | SREBP1 | SREBP1A | BHLHD1
描述 固醇调节元件结合转录因子1
参考 MIM：184756|HGNC：HGNC：11289|Ensembl：ENSG00000072310|HPRD：01701|Vega：Otthumg0000000059313
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p11.2
Pascal P值 2.674E-7
胎儿β -0.234
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG03641529 17 17716218 SREBF1 1.292E-4 0.599 0.03 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SP1 0.89 0.91
TCF12 0.88 0.87
ZFAND3 0.88 0.84
tob2 0.88 0.86
PARP1 0.87 0.84
休息 0.87 0.86
fubp3 0.87 0.84
PHF8 0.86 0.86
CTDSP2 0.86 0.85
DHTKD1 0.86 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.60 -0.68
ifi27 -0.57 -0.61
IL32 -0.54 -0.63
AF347015.31 -0.54 -0.60
MT-CO2 -0.54 -0.59
C1orf54 -0.53 -0.59
CXCL14 -0.53 -0.60
myl3 -0.53 -0.56
Sycp3 -0.52 -0.55
AC044839.2 -0.51 -0.60

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003700 转录因子活性 艾达 16407292
去：0003702 RNA聚合酶II转录因子活性 塔斯 8156598
去：0005515 蛋白质结合 IPI 16799563
GO：0032810 固醇响应元件结合 艾达 16407292
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 8156598
去：0008202 类固醇代谢过程 IEA -
去：0008203 胆固醇代谢过程 IEA -
去：0009267 细胞对饥饿的反应 ISS 16407292
去：0006629 脂质代谢过程 塔斯 8156598
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000139 高尔基膜 IEA -
去：0005794 高尔基体 IEA -
去：0005789 内质网膜 塔斯 8156598
去：0005634 核 塔斯 8156598
去：0005635 核信封 塔斯 8156598
去：0005783 内质网 IEA -
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
GO：0031410 细胞质囊泡 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA级联级联 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MTOR 4 Pathway 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RXR VDR途径 26 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID caspase途径 52 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Ppara激活基因表达 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Rora激活昼夜节律表达 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome昼夜节律 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌簇7 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6信号疤痕向上 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成4 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C5的反应 46 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild E2F3致癌特征 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔内B 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Myc Up监管 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta EBNA1反相关 173 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dasu IL6信号向上 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-142-5p 486 492 M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac