基因页:SREBF2
Summary?
GeneID | 6721 |
象征 | SREBF2 |
同义词 | SREBP-2 | SREBP2 | BHLHD2 |
描述 | 固醇调节元件结合转录因子2 |
参考 | MIM:600481|HGNC:HGNC:11290|Ensembl:ENSG00000198911|HPRD:02726|Vega:Otthumg00000151261 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22Q13 |
Pascal P值 | 1.112E-6 |
Sherlock P值 | 0.273 |
胎儿β | 0.378 |
支持 | CompositeSet Darnell FMRP目标 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SREBF2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
去:0003702 | RNA聚合酶II转录因子活性 | 塔斯 | 7903453 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10976766|15527767 | |
GO:0030528 | 转录调节器活性 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0006357 | 调节RNA聚合酶II启动子的转录 | 塔斯 | 7903453 | |
去:0008202 | steroid metabolic process | IEA | - | |
去:0008203 | 胆固醇代谢过程 | IEA | - | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | 塔斯 | 7903453 | |
GO:0045449 | 转录的调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - | |
GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
GO:0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
第四节。蛋白质teraction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
casp3 | CPP32 |CPP32B |SCA-1 | caspase 3,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD,Biogrid | 8605870 |
克雷布 | CBP |kat3a |RST | CREB结合蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 8918891 |
EP300 | KAT3B | p300 | E1a结合蛋白p300 | - | HPRD,Biogrid | 8918891 |
Insig1 | Cl-6 |MGC1405 | 胰岛素诱导的基因1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12202038|12842885 |
Insig2 | MGC26273 | 胰岛素诱导的基因2 | - | HPRD | 12242332 |
KPNB1 | IMB1 |IPOB |impnb |MGC2155 |MGC2156 |MGC2157 |NTF97 | 核桃蛋白(importin)beta 1 | 重构的复合物 | Biogrid | 11283257 |
MAPK1 | ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk | 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 | - | HPRD,Biogrid | 10627507 |
MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | - | HPRD,Biogrid | 10627507 |
scap | KIAA0199 | SREBF伴侣 | - | HPRD | 10896675 |
Smad3 | DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 | SMAD家庭成员3 | SMAD3与SREBPF2(SREBP2)相互作用。 | 绑定 | 15527767 |
SP1 | - | SP1转录因子 | - | HPRD,Biogrid | 10976766 |
SREBF2 | SREBP2 |BHLHD2 | 固醇调节元件结合转录因子2 | - | HPRD,Biogrid | 11283257 |
SUMO1 | DAP-1 |GMP1 |OFC10 |pic1 |senp2 |SMT3 |SMT3C |SMT3H3 |Sumo-1 |UBL1 | MIF的SMT3抑制器两个3同源物1(S. cerevisiae) | - | HPRD | 12615929 |
ube2i | C358B7.1 |P18 |UBC9 | 泛素结合酶E2I(UBC9同源物,酵母) | - | HPRD,Biogrid | 12615929 |