Summary
GeneID 6721
象征 SREBF2
同义词 SREBP-2 | SREBP2 | BHLHD2
描述 固醇调节元件结合转录因子2
参考 MIM:600481|HGNC:HGNC:11290|Ensembl:ENSG00000198911|HPRD:02726|Vega:Otthumg00000151261
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q13
Pascal P值 1.112E-6
Sherlock P值 0.273
胎儿β 0.378
支持 CompositeSet
Darnell FMRP目标

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 IEA -
去:0003702 RNA聚合酶II转录因子活性 塔斯 7903453
去:0005515 蛋白质结合 IPI 10976766|15527767
GO:0030528 转录调节器活性 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 7903453
去:0008202 steroid metabolic process IEA -
去:0008203 胆固醇代谢过程 IEA -
去:0006629 脂质代谢过程 塔斯 7903453
GO:0045449 转录的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005634 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
GO:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -

第四节。蛋白质teraction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
casp3 CPP32 |CPP32B |SCA-1 caspase 3,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD,Biogrid 8605870
克雷布 CBP |kat3a |RST CREB结合蛋白 - HPRD,Biogrid 8918891
EP300 KAT3B | p300 E1a结合蛋白p300 - HPRD,Biogrid 8918891
Insig1 Cl-6 |MGC1405 胰岛素诱导的基因1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12202038|12842885
Insig2 MGC26273 胰岛素诱导的基因2 - HPRD 12242332
KPNB1 IMB1 |IPOB |impnb |MGC2155 |MGC2156 |MGC2157 |NTF97 核桃蛋白(importin)beta 1 重构的复合物 Biogrid 11283257
MAPK1 ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 - HPRD,Biogrid 10627507
MAPK3 ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 - HPRD,Biogrid 10627507
scap KIAA0199 SREBF伴侣 - HPRD 10896675
Smad3 DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 SMAD家庭成员3 SMAD3与SREBPF2(SREBP2)相互作用。 绑定 15527767
SP1 - SP1转录因子 - HPRD,Biogrid 10976766
SREBF2 SREBP2 |BHLHD2 固醇调节元件结合转录因子2 - HPRD,Biogrid 11283257
SUMO1 DAP-1 |GMP1 |OFC10 |pic1 |senp2 |SMT3 |SMT3C |SMT3H3 |Sumo-1 |UBL1 MIF的SMT3抑制器两个3同源物1(S. cerevisiae) - HPRD 12615929
ube2i C358B7.1 |P18 |UBC9 泛素结合酶E2I(UBC9同源物,酵母) - HPRD,Biogrid 12615929


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
SA级联级联 19 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Ppara激活基因表达 104 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME METABOLISM OF LIPIDS AND LIPOPROTEINS 478 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
家长mtor信号向上 567 375 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标 473 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标 775 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
宁慢性阻塞性肺疾病DN 121 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ferrando T与MLL融合一起 87 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lenaour树突状细胞成熟DN 128 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krasnoselskaya ILF3靶向DN 46 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhang GATA6靶向DN 64 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 All SZGR 2.0 genes in this pathway
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoffmann小型BII至未成熟B淋巴细胞DN 50 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cheok对胃嘌呤和高清MTX DN的反应 25 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI假足趋化性DN 457 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足型haptotaxis dn 668 419 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌生存DN 113 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S2 115 74 All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝母细胞瘤 207 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肢体芽中的schmidt por目标 26 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 All SZGR 2.0 genes in this pathway