基因页:SSBP1
概括?
基因 | 6742 |
象征 | SSBP1 |
同义词 | MT-SSB | SOSS-B1 | SSBP | MTSSB |
描述 | 单链DNA结合蛋白1,线粒体 |
参考 | MIM:600439|HGNC:HGNC:11317|ENSEMBL:ENSG00000106028|HPRD:02703|Vega:Otthumg00000157572 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q34 |
Pascal P值 | 0.45 |
Sherlock P值 | 0.255 |
胎儿β | -0.008 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG26449836 | 7 | 141438150 | SSBP1 | -0.02 | 0.94 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17712061 | CHR5 | 18173266 | SSBP1 | 6742 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SSBP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
nudt21 | 0.94 | 0.96 |
ythdf3 | 0.94 | 0.95 |
CAND1 | 0.94 | 0.94 |
ARMC1 | 0.93 | 0.94 |
OSBPL8 | 0.93 | 0.95 |
FYTTD1 | 0.93 | 0.94 |
SCAMP1 | 0.93 | 0.95 |
TTC33 | 0.93 | 0.94 |
Azin1 | 0.92 | 0.94 |
PPP1CB | 0.92 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.68 | -0.78 |
AC018755.7 | -0.67 | -0.72 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.77 |
AF347015.33 | -0.65 | -0.73 |
AF347015.31 | -0.65 | -0.74 |
higd1b | -0.64 | -0.75 |
mt-cyb | -0.63 | -0.73 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.75 |
AF347015.26 | -0.62 | -0.71 |
AF347015.2 | -0.62 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG DNA复制 | 36 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG不匹配维修 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG同源重组 | 28 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
考夫曼DNA复制基因 | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1向上 | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn alpha响应 | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn beta响应 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn伽马响应 | 71 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 | 73 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德斯癌元签名 | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rhodes未分化的癌症 | 69 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC的反应 | 123 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级转移DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马洛尼对17AAG DN的回应 | 79 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |