概括
基因 6751
象征 SSTR1
同义词 SRIF-2 | SS-1-R | SS1-R | SS1R
描述 生长抑素受体1
参考 MIM:182451|HGNC:HGNC:11330|ENSEMBL:ENSG00000139874|HPRD:01673|Vega:Otthumg00000140249
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q13
Pascal P值 0.971
胎儿β -3.42

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0004994 生长抑素受体活性 艾达 1346068
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007218 神经肽信号通路 IEA 神经递质(GO期限:8) -
去:0007215 谷氨酸信号通路 IEA 谷氨酸(GO期限:7) -
去:0007187 G蛋白信号传导,与环状核苷酸第二信使耦合 塔斯 8405411
去:0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 1346068
去:0008285 细胞增殖的阴性调节 塔斯 9886848
去:0007586 消化 塔斯 1346068
去:0007584 对养分的反应 塔斯 1346068
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005624 膜分数 IEA -
去:0005886 质膜 塔斯 1346068
去:0005887 质膜的积分 塔斯 1346068

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽配体结合受体 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vecchi胃癌先进与早期DN 138 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSADA ASCL1靶向 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 220 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-375 2276 2282 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga