基因页：SSTR2
概括？
| 基因 | 6752 |
| 象征 | SSTR2 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 生长抑素受体2 |
| 参考 | MIM：182452|HGNC：HGNC：11331|HPRD：01674| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17Q24 |
| Pascal P值 | 0.943 |
| 胎儿β | 0.473 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG06685177 | 17 | 71161322 | SSTR2 | 1.499E-4 | -0.391 | 0.032 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16977927 | CHR17 | 72154232 | SSTR2 | 6752 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS17638742 | CHR3 | 28326697 | SSTR2 | 6752 | 0.01 | 反式 | ||
| RS11706542 | CHR3 | 28328582 | SSTR2 | 6752 | 0.04 | 反式 | ||
| RS17638991 | CHR3 | 28350968 | SSTR2 | 6752 | 0.03 | 反式 | ||
| RS11720107 | CHR3 | 28472727 | SSTR2 | 6752 | 0.07 | 反式 | ||
| RS17696459 | CHR3 | 28491284 | SSTR2 | 6752 | 0.02 | 反式 | ||
| RS1598846 | CHR3 | 28510452 | SSTR2 | 6752 | 0.02 | 反式 | ||
| RS17696783 | CHR3 | 28537610 | SSTR2 | 6752 | 0.06 | 反式 | ||
| RS7433570 | 0 | SSTR2 | 6752 | 0.02 | 反式 | |||
| RS4133027 | CHR3 | 28624326 | SSTR2 | 6752 | 0.17 | 反式 | ||
| RS3809540 | CHR15 | 55489411 | SSTR2 | 6752 | 0.18 | 反式 | ||
| RS7165491 | CHR15 | 55500454 | SSTR2 | 6752 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| myo5a | 0.94 | 0.96 |
| hecw2 | 0.93 | 0.94 |
| lonrf2 | 0.93 | 0.95 |
| SYT16 | 0.93 | 0.93 |
| pclo | 0.92 | 0.94 |
| FAM126B | 0.91 | 0.94 |
| UBR3 | 0.91 | 0.93 |
| LMTK2 | 0.90 | 0.90 |
| DGKE | 0.90 | 0.89 |
| plekhm3 | 0.90 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Rab34 | -0.55 | -0.69 |
| EFEMP2 | -0.53 | -0.58 |
| DBI | -0.52 | -0.67 |
| Rhoc | -0.51 | -0.65 |
| C19orf36 | -0.49 | -0.58 |
| ACSF2 | -0.49 | -0.62 |
| GATSL3 | -0.48 | -0.57 |
| TLCD1 | -0.48 | -0.58 |
| C1orf61 | -0.48 | -0.73 |
| ACP6 | -0.47 | -0.51 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0004994 | 生长抑素受体活性 | 塔斯 | 7914078 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10551867 | |
| 去：0030165 | PDZ结构域结合 | IPI | 10551867 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007218 | 神经肽信号通路 | IEA | 神经递质（GO期限：8） | - |
| 去：0007187 | G蛋白信号传导，与环状核苷酸第二信使耦合 | 塔斯 | 7914078 | |
| 去：0007267 | 细胞细胞信号传导 | 塔斯 | 1346068 | |
| 去：0007193 | G蛋白信号传导，腺苷酸环化酶抑制途径 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | 塔斯 | 9892014 | |
| 去：0007586 | 消化 | 塔斯 | 1346068 | |
| 去：0007584 | 对养分的反应 | 塔斯 | 1346068 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005886 | 质膜 | 塔斯 | 7914078 | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 7914078 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PTCH1和Sufu的Lee目标 | 53 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasaki成人T细胞白血病 | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭雷帕霉素的反应 | 203 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova在APL中甲基化 | 68 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahajan对IL1A的回应 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OSADA ASCL1靶向 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS HCP与H3未甲基化 | 80 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES HCP与H3未甲基化 | 63 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹通过FN1信号传导翻译 | 35 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO TH1细胞毒性模块 | 114 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |