基因页:SSTR5
概括?
基因 | 6755 |
象征 | SSTR5 |
同义词 | SS-5-R |
描述 | 生长抑素受体5 |
参考 | MIM:182455|HGNC:HGNC:11334|HPRD:01677| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p13.3 |
Pascal P值 | 0.958 |
胎儿β | -0.004 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SSTR5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MSH5 | 0.58 | 0.50 |
NPEPL1 | 0.57 | 0.42 |
CCDC84 | 0.56 | 0.47 |
PABPC1L | 0.56 | 0.46 |
KIAA1407 | 0.56 | 0.48 |
vars2 | 0.55 | 0.44 |
AC008686.2 | 0.55 | 0.39 |
CILP | 0.55 | 0.35 |
stac3 | 0.55 | 0.43 |
Ager | 0.55 | 0.44 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tuba1 | -0.33 | -0.37 |
TPST2 | -0.33 | -0.37 |
CCM2 | -0.33 | -0.36 |
Faim2 | -0.32 | -0.35 |
pink1 | -0.32 | -0.34 |
HLA-C | -0.31 | -0.33 |
pah | -0.31 | -0.32 |
SQSTM1 | -0.31 | -0.35 |
阿尔多亚 | -0.31 | -0.31 |
FBXO2 | -0.31 | -0.33 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌16p13 Amplicon | 120 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kinney DNMT1甲基化靶标 | 14 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |