概括
基因 6770
象征 星星
同义词 Stard1
描述 类固醇急性调节蛋白
参考 MIM:600617|HGNC:HGNC:11359|HPRD:02794|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p11.2
Pascal P值 1.835E-5
Sherlock P值 0.475
胎儿beta -1.725
耶和华 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
PMID:COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4688198 CHR3 64447242 星星 6770 0.18 反式
RS1729975 CHR3 98239453 星星 6770 0.13 反式
RS11705496 CHR22 49784666 星星 6770 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM50A 0.83 0.82
ARFRP1 0.79 0.77
CDC37 0.79 0.79
gripap1 0.73 0.73
tceal5 0.73 0.74
DDX41 0.73 0.71
PSMC5 0.72 0.71
GPKOW 0.71 0.69
bex4 0.71 0.74
钩2 0.71 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.54 -0.45
AF347015.31 -0.54 -0.48
HBD -0.53 -0.53
CLEC2B -0.53 -0.42
MT1G -0.53 -0.44
HBB -0.52 -0.53
C1orf54 -0.50 -0.40
增强 -0.50 -0.46
mt1e -0.50 -0.41
MT-CO2 -0.49 -0.43

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
类固醇激素和维生素A和D的反应组代谢 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组类固醇激素 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wilcox对孕酮DN的反应 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨型性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1向上 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8p12 P11 Amplicon 57 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson FSH响应 9 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK类固醇生成 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白的反应 91 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin的回应 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
绅士白血病干细胞DN 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因