基因页:星星
概括?
基因 | 6770 |
象征 | 星星 |
同义词 | Stard1 |
描述 | 类固醇急性调节蛋白 |
参考 | MIM:600617|HGNC:HGNC:11359|HPRD:02794| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p11.2 |
Pascal P值 | 1.835E-5 |
Sherlock P值 | 0.475 |
胎儿beta | -1.725 |
耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID:COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4688198 | CHR3 | 64447242 | 星星 | 6770 | 0.18 | 反式 | ||
RS1729975 | CHR3 | 98239453 | 星星 | 6770 | 0.13 | 反式 | ||
RS11705496 | CHR22 | 49784666 | 星星 | 6770 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共同表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM50A | 0.83 | 0.82 |
ARFRP1 | 0.79 | 0.77 |
CDC37 | 0.79 | 0.79 |
gripap1 | 0.73 | 0.73 |
tceal5 | 0.73 | 0.74 |
DDX41 | 0.73 | 0.71 |
PSMC5 | 0.72 | 0.71 |
GPKOW | 0.71 | 0.69 |
bex4 | 0.71 | 0.74 |
钩2 | 0.71 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.54 | -0.45 |
AF347015.31 | -0.54 | -0.48 |
HBD | -0.53 | -0.53 |
CLEC2B | -0.53 | -0.42 |
MT1G | -0.53 | -0.44 |
HBB | -0.52 | -0.53 |
C1orf54 | -0.50 | -0.40 |
增强 | -0.50 | -0.46 |
mt1e | -0.50 | -0.41 |
MT-CO2 | -0.49 | -0.43 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
类固醇激素和维生素A和D的反应组代谢 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组类固醇激素 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wilcox对孕酮DN的反应 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨型性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1向上 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DODD鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌 | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8p12 P11 Amplicon | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson FSH响应 | 9 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK类固醇生成 | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对促性腺营养蛋白的反应 | 91 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对Forskolin的回应 | 90 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
绅士白血病干细胞DN | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |