概括
基因 6785
象征 Elovl4
同义词 ADMD | CT118 | ISQMR | SCA34 | STGD2 | STGD3
描述 Elovl脂肪酸延伸酶4
参考 MIM:605512|HGNC:HGNC:14415|ENSEMBL:ENSG00000118402|HPRD:05697|Vega:Otthumg0000000015087
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q14
Pascal P值 0.056
Sherlock P值 0.522
胎儿β -0.658
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24859546 6 80654763 Elovl4 1.522E-4 0.499 0.032 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008020 G蛋白偶联的光感受器活性 nas 11138005
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007601 视觉感知 IEA -
去:0006633 脂肪酸生物合成过程 nas 11138005
GO:0050896 对刺激的反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005575 cellular_component nd -
去:0005783 内质网 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组甘油三酸酯的生物合成 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Fatty Acyl COA生物合成 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组合成非常长的链脂肪酰基COA 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进度DN 100 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi对romidepsin的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 DN 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李双极性胸腺细胞 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Winzen通过KHSRP退化 100 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 918 924 M8 HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-124.1 11 17 1a HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-128 679 685 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-217 1594年 1600 M8 HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-218 1762年 1768年 1a HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-25/32/92/363/367 1177 1184 1A,M8 HSA-MIR-25 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-29 1197 1204 1A,M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-329 1678年 1684年 1a HSA-MIR-329 aacacaccugguaaccucuuu
mir-409-3p 1711 1717年 M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-500 1176 1182 1a HSA-MIR-500 augcaccuggggaggagauucug
mir-9 233 239 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga