基因页:Elovl4
概括?
基因 | 6785 |
象征 | Elovl4 |
同义词 | ADMD | CT118 | ISQMR | SCA34 | STGD2 | STGD3 |
描述 | Elovl脂肪酸延伸酶4 |
参考 | MIM:605512|HGNC:HGNC:14415|ENSEMBL:ENSG00000118402|HPRD:05697|Vega:Otthumg0000000015087 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q14 |
Pascal P值 | 0.056 |
Sherlock P值 | 0.522 |
胎儿β | -0.658 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24859546 | 6 | 80654763 | Elovl4 | 1.522E-4 | 0.499 | 0.032 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ELOVL4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008020 | G蛋白偶联的光感受器活性 | nas | 11138005 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007601 | 视觉感知 | IEA | - | |
去:0006633 | 脂肪酸生物合成过程 | nas | 11138005 | |
GO:0050896 | 对刺激的反应 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005575 | cellular_component | nd | - | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组甘油三酸酯的生物合成 | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Fatty Acyl COA生物合成 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组合成非常长的链脂肪酰基COA | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马皮肤癌进度DN | 100 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi对romidepsin的反应 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 DN | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李双极性胸腺细胞 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Winzen通过KHSRP退化 | 100 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 918 | 924 | M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-124.1 | 11 | 17 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-128 | 679 | 685 | M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
mir-217 | 1594年 | 1600 | M8 | HSA-MIR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
mir-218 | 1762年 | 1768年 | 1a | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
mir-25/32/92/363/367 | 1177 | 1184 | 1A,M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
mir-29 | 1197 | 1204 | 1A,M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
mir-329 | 1678年 | 1684年 | 1a | HSA-MIR-329脑 | aacacaccugguaaccucuuu |
mir-409-3p | 1711 | 1717年 | M8 | HSA-MIR-409-3P | cgauauguugcucggugaaccccu |
mir-500 | 1176 | 1182 | 1a | HSA-MIR-500 | augcaccuggggaggagauucug |
mir-9 | 233 | 239 | M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |