概括
基因 6786
象征 Stim1
同义词 D11S4896E | GOK | IMD10 | Strmk | Tam | Tam1
描述 基质相互作用分子1
参考 MIM:605921|HGNC:HGNC:11386|ENSEMBL:ENSG00000167323|HPRD:05803|Vega:Otthumg00000133360
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.5
Pascal P值 0.378
Sherlock P值 0.159
胎儿β -1.599
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9313483 CHR5 169448229 Stim1 6786 0.18 反式
RS9313484 CHR5 169448319 Stim1 6786 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID TCR途径 66 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR途径 53 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原激活B细胞受体,导致第二使者产生 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胞质Ca2水平的反应组升高 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板稳态 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板钙稳态 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常DN 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
动摇对雄激素DN的反应 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1的Garcia目标 57 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈神经母细胞瘤副本编号收益 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peart HDAC增殖集群 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因