基因页:Stim1
概括?
基因 | 6786 |
象征 | Stim1 |
同义词 | D11S4896E | GOK | IMD10 | Strmk | Tam | Tam1 |
描述 | 基质相互作用分子1 |
参考 | MIM:605921|HGNC:HGNC:11386|ENSEMBL:ENSG00000167323|HPRD:05803|Vega:Otthumg00000133360 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.5 |
Pascal P值 | 0.378 |
Sherlock P值 | 0.159 |
胎儿β | -1.599 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9313483 | CHR5 | 169448229 | Stim1 | 6786 | 0.18 | 反式 | ||
RS9313484 | CHR5 | 169448319 | Stim1 | 6786 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/STIM1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID TCR途径 | 66 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD8 TCR途径 | 53 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原激活B细胞受体,导致第二使者产生 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胞质Ca2水平的反应组升高 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板钙稳态 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王食道癌与正常DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
动摇对雄激素DN的反应 | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLI1和DAX1的Garcia目标 | 57 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈神经母细胞瘤副本编号收益 | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peart HDAC增殖集群 | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |