基因页:STK4
概括?
基因 | 6789 |
象征 | STK4 |
同义词 | KRS2 | MST1 | TIIAC | YSK3 |
描述 | 丝氨酸/苏氨酸激酶4 |
参考 | MIM:604965|HGNC:HGNC:11408|ENSEMBL:ENSG00000101109|HPRD:05395|Vega:Otthumg00000033059 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20Q11.2-Q13.2 |
Pascal P值 | 1.315E-5 |
Sherlock P值 | 0.487 |
胎儿β | -0.186 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4985452 | CHR16 | 69945140 | STK4 | 6789 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/STK4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Neurl4 | 0.95 | 0.95 |
EHMT2 | 0.93 | 0.95 |
RNF40 | 0.93 | 0.93 |
Rab35 | 0.93 | 0.93 |
KIAA1967 | 0.93 | 0.94 |
SF3B2 | 0.93 | 0.93 |
TUBGCP2 | 0.93 | 0.94 |
USP19 | 0.93 | 0.94 |
GTPBP1 | 0.93 | 0.94 |
ranbp3 | 0.92 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.84 | -0.89 |
MT-CO2 | -0.82 | -0.88 |
AF347015.21 | -0.79 | -0.91 |
AF347015.27 | -0.79 | -0.87 |
AF347015.33 | -0.79 | -0.84 |
AF347015.8 | -0.78 | -0.86 |
mt-cyb | -0.77 | -0.84 |
ifi27 | -0.77 | -0.83 |
higd1b | -0.77 | -0.85 |
FXYD1 | -0.77 | -0.83 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG非小细胞肺癌 | 54 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
河马的Reactome信号传导 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与小叶正常 | 73 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳腺癌导管与小叶 | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr的Takeda目标 | 85 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 | 143 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TSAI对电离辐射的响应 | 149 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon | 149 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu IL4信号传导 | 94 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
量缺氧 | 98 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟B | 53 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手DN | 116 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stambolsky对维生素D3的反应 | 84 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |