概括
基因 6789
象征 STK4
同义词 KRS2 | MST1 | TIIAC | YSK3
描述 丝氨酸/苏氨酸激酶4
参考 MIM:604965|HGNC:HGNC:11408|ENSEMBL:ENSG00000101109|HPRD:05395|Vega:Otthumg00000033059
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20Q11.2-Q13.2
Pascal P值 1.315E-5
Sherlock P值 0.487
胎儿β -0.186
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4985452 CHR16 69945140 STK4 6789 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Neurl4 0.95 0.95
EHMT2 0.93 0.95
RNF40 0.93 0.93
Rab35 0.93 0.93
KIAA1967 0.93 0.94
SF3B2 0.93 0.93
TUBGCP2 0.93 0.94
USP19 0.93 0.94
GTPBP1 0.93 0.94
ranbp3 0.92 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.84 -0.89
MT-CO2 -0.82 -0.88
AF347015.21 -0.79 -0.91
AF347015.27 -0.79 -0.87
AF347015.33 -0.79 -0.84
AF347015.8 -0.78 -0.86
mt-cyb -0.77 -0.84
ifi27 -0.77 -0.83
higd1b -0.77 -0.85
FXYD1 -0.77 -0.83

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG非小细胞肺癌 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
河马的Reactome信号传导 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与小叶正常 73 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳腺癌导管与小叶 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr的Takeda目标 85 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对电离辐射的响应 149 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon 149 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu IL4信号传导 94 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAIN NFKB信号 75 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
量缺氧 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟B 53 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stambolsky对维生素D3的反应 84 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因