概括
基因 6792
象征 CDKL5
同义词 CFAP247 | EIEE2 | ISSX | STK9
描述 细胞周期蛋白依赖性激酶像5
参考 MIM:300203|HGNC:HGNC:11411|Ensembl:ENSG00000008086|HPRD:02190|Vega:Otthumg00000021214
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XP22
胎儿β 0.062
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
UTP6 0.91 0.88
Trip4 0.90 0.88
WDR70 0.90 0.90
zbed5 0.90 0.90
Tra2a 0.90 0.88
ZNF187 0.89 0.88
polr3c 0.89 0.89
CSTF3 0.89 0.88
标记3 0.89 0.86
rae1 0.89 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.80 -0.83
AF347015.27 -0.80 -0.83
AF347015.33 -0.79 -0.82
AF347015.31 -0.78 -0.82
AF347015.8 -0.78 -0.83
AF347015.15 -0.78 -0.83
mt-cyb -0.78 -0.82
HLA-F -0.78 -0.80
AF347015.2 -0.77 -0.85
tinagl1 -0.76 -0.80

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008236 丝氨酸型肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:6) -
去:0004693 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性 IEA 神经元(GO期限:8) -
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 艾达 16935860
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
GO:0046777 蛋白氨基酸自磷酸化 艾达 16935860
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 艾达 16935860
去:0005737 细胞质 艾达 18029348
去:0016020 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典 62 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoegerkorp CD44靶向直接 27 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN 91 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因