基因页:CDKL5
概括?
基因 | 6792 |
象征 | CDKL5 |
同义词 | CFAP247 | EIEE2 | ISSX | STK9 |
描述 | 细胞周期蛋白依赖性激酶像5 |
参考 | MIM:300203|HGNC:HGNC:11411|Ensembl:ENSG00000008086|HPRD:02190|Vega:Otthumg00000021214 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XP22 |
胎儿β | 0.062 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CDKL5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
UTP6 | 0.91 | 0.88 |
Trip4 | 0.90 | 0.88 |
WDR70 | 0.90 | 0.90 |
zbed5 | 0.90 | 0.90 |
Tra2a | 0.90 | 0.88 |
ZNF187 | 0.89 | 0.88 |
polr3c | 0.89 | 0.89 |
CSTF3 | 0.89 | 0.88 |
标记3 | 0.89 | 0.86 |
rae1 | 0.89 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.80 | -0.83 |
AF347015.27 | -0.80 | -0.83 |
AF347015.33 | -0.79 | -0.82 |
AF347015.31 | -0.78 | -0.82 |
AF347015.8 | -0.78 | -0.83 |
AF347015.15 | -0.78 | -0.83 |
mt-cyb | -0.78 | -0.82 |
HLA-F | -0.78 | -0.80 |
AF347015.2 | -0.77 | -0.85 |
tinagl1 | -0.76 | -0.80 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008236 | 丝氨酸型肽酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:6) | - |
去:0004693 | 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性 | IEA | 神经元(GO期限:8) | - |
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | 艾达 | 16935860 | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
GO:0046777 | 蛋白氨基酸自磷酸化 | 艾达 | 16935860 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 16935860 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典 | 62 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoegerkorp CD44靶向直接 | 27 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Cycling基因 | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G2 | 182 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时DN | 91 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |