基因页面:STX1A

总结吗?
GeneID 6804年
象征 STX1A
同义词 HPC-1 | P35-1 | STX1 | SYN1A
描述 突触融合蛋白1
参考 MIM: 186590|HGNC: HGNC: 11433|运用:ENSG00000106089|HPRD: 01721|织女:OTTHUMG00000137422
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 7 q11.23
帕斯卡假定值 0.287
夏洛克假定值 0.956
胎儿β -1.607
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 胞外分泌
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_clathrin
G2Cdb.human_Synaptosome
G2Cdb.humanNRC
CompositeSet
潜在的突触基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异的研究 人工管理
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
协会 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 2 链接到SZGene
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:2
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.0456

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg06480942 7 73116029 STX1A 3.042的军医 0.621 0.04 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs10958896 chr9 10126894 STX1A 6804年 0.1 反式
rs10958899 chr9 10128700 STX1A 6804年 0.06 反式
rs10958907 chr9 10131580 STX1A 6804年 0.13 反式
rs1322159 chr9 10132695 STX1A 6804年 0.15 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
CALM3 0.92 0.91
SYP 0.89 0.93
MOAP1 0.88 0.88
ATP6V1G2 0.88 0.88
SPRYD3 0.88 0.90
ARF3 0.87 0.87
TPRG1L 0.87 0.90
SULT4A1 0.86 0.91
AC073610.6 0.86 0.86
AC005277.1 0.86 0.88
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
RAB13 -0.46 -0.53
BCL7C -0.41 -0.47
RPS20 -0.39 -0.43
GRTP1 -0.39 -0.40
C9orf46 -0.39 -0.36
HYAL2 -0.39 -0.40
GPR125 -0.39 -0.38
CLIC1 -0.38 -0.53
RPL34 -0.38 -0.42
CDC42EP4 -0.38 -0.36

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000149 网罗绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005484 提前受体活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0019855 钙通道抑制剂活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007268 突触传递 国际能源机构 Synap神经元,神经递质(术语层面:6) - - - - - -
去:0006836 神经递质运输 国际能源机构 神经元,神经递质(术语层面:5) - - - - - -
去:0006886 细胞内蛋白质的运输 国际能源机构 - - - - - -
去:0016192 vesicle-mediated运输 国际能源机构 - - - - - -
去:0017156 钙ion-dependent胞外分泌 国际能源机构 - - - - - -
去:0050796 调节胰岛素分泌 助教 15537656
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 国际能源机构 - - - - - -
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 经验值 8611567
去:0005886 等离子体膜 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
APBA1 D9S411E | MINT1 | X11 | X11A | X11ALPHA β淀粉样蛋白前体此种(A4),家庭,成员1 - - - - - - HPRD 9395480
ATP6V1B1 ATP6B1 | MGC32642 | RTA1B | VATB | VMA2 | VPP3 atp酶、H +运输,溶酶体56/58kDa V1亚基B1 重新组成复杂 BioGRID 12651853
CACNA1D CACH3 | CACN4 | CACNL1A2 | CCHL1A2 | Cav1.3 钙通道,压敏电阻器,L型,α1 d单元 - - - - - - HPRD 10468580
CDK5 PSSALRE 细胞周期蛋白依赖性激酶5 - - - - - - HPRD, BioGRID 9478941
雌性生殖道 ABC35 | ABCC7 | CF |雌性生殖道/ MRP | MRP7 | TNR-CFTR | dJ760C5.1 囊性纤维化跨膜电导调节(磷酸腺苷盒式sub-family C,成员7) 突触融合蛋白与雌性生殖道。 绑定 9384384|12446681
雌性生殖道 ABC35 | ABCC7 | CF |雌性生殖道/ MRP | MRP7 | TNR-CFTR | dJ760C5.1 囊性纤维化跨膜电导调节(磷酸腺苷盒式sub-family C,成员7) - - - - - - HPRD, BioGRID 9384384
CPLX1 CPX-I | CPX1 complexin 1 亲和力Capture-Western
Co-crystal结构
重新组成复杂		 BioGRID 10449403|11832227
|12200427
CPLX1 CPX-I | CPX1 complexin 1 - - - - - - HPRD 7553862
CPLX2 921 - l | CPX-2 | CPX2 | Hfb1 | MGC138492 complexin 2 亲和力Capture-Western BioGRID 10449403
KCNB1 DRK1 | KV2.1 | h-DRK1 电压门控钾通道,Shab-related亚科,成员1 - - - - - - HPRD 12403834
KIAA1128 FLJ14262 | FLJ25809 | Gcap14 | bA486O22.1 KIAA1128 2台混合动力 BioGRID 16169070
纳帕 SNAPA 附件蛋白质N-ethylmaleimide-sensitive因素,α 亲和力Capture-Western
重新组成复杂		 BioGRID 7553862|7622514
NSF SKD2 N-ethylmaleimide-sensitive因素 - - - - - - HPRD 7622514
PSEN1 AD3粉|时尚| PS1 | S182 presenilin 1 PS1 1与突触融合蛋白相互作用。 绑定 10891589
RAB27A GS2 | HsT18676 | MGC117246 | RAB27 | RAM RAB27A, RAS致癌基因家族成员 - - - - - - HPRD 12101244
RNF40 BRE1B | DKFZp686K191 | KIAA0661 | MGC13051 | RBP95 |凝视 无名指蛋白质40 亲和力Capture-Western
重新组成复杂		 BioGRID 12121982
SCNN1A ENaCa | ENaCalpha | FLJ21883 | SCNEA | SCNN1 钠离子通道,nonvoltage-gated 1α 亲和力Capture-Western BioGRID 14996668
SCNN1B ENaCb | ENaCbeta | SCNEB 钠离子通道,nonvoltage-gated 1,β 亲和力Capture-Western BioGRID 14996668
SCNN1B ENaCb | ENaCbeta | SCNEB 钠离子通道,nonvoltage-gated 1,β - - - - - - HPRD 11845306
SCNN1G ENaCg | ENaCgamma | PHA1 | SCNEG 钠离子通道,nonvoltage-gated 1,γ - - - - - - HPRD, BioGRID 14996668
SEPT2 DIFF6 | KIAA0158 | NEDD5 | Pnutl3 | hNedd5 septin 2 - - - - - - HPRD 10321247
SEPT5 CDCREL | CDCREL-1 | CDCREL1 | H5 | PNUTL1 septin 5 - - - - - - HPRD 10321247
SLC6A1 GABATHG | GABATR | GAT1 溶质载体家庭6(神经递质转运体,GABA),成员1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9698305|11017172
|11960023
SLC6A3 DAT | DAT1 溶质载体家庭6(神经递质转运体,多巴胺),成员3 DAT与Syn1A交互。 绑定 15202772
SLC6A4 计画计画5 - HTT基因| 5 | | OCD1 |泽特| hSERT 溶质载体家庭6(5 -羟色胺神经递质转运体),成员4 - - - - - - HPRD, BioGRID 12175857
SLC6A5 GLYT2 | NET1 溶质载体家庭6(神经递质转运体,甘氨酸),成员5 亲和力Capture-Western BioGRID 10722844
SLC6A9 DKFZp547A1118 | GLYT1 溶质载体家庭6(神经递质转运体,甘氨酸),成员9 - - - - - - HPRD, BioGRID 10722844
SNAP23 HsT17016 | SNAP23A | SNAP23B synaptosomal-associated蛋白质,23 kda - - - - - - HPRD 12209004 | 12209004
SNAP23 HsT17016 | SNAP23A | SNAP23B synaptosomal-associated蛋白质,23 kda 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
2台混合动力		 BioGRID 8663154|9168999
|9852078|12651853
|12828989
SNAP25 FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 |弹簧| SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 synaptosomal-associated蛋白质,25 kda - - - - - - HPRD 7622514|7768895
|9556632|10373452
|11509230 | 11509230
SNAP25 FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 |弹簧| SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 synaptosomal-associated蛋白质,25 kda - - - - - - HPRD 7622514|9556632 | 9556632
SNAP25 FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 |弹簧| SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 synaptosomal-associated蛋白质,25 kda 亲和力Capture-Western
Co-crystal结构
重新组成复杂
2台混合动力		 BioGRID 7553862|7768895
|7961655|8663154
|9852078|10195194
|10449403|10954418
|11524423|11832227
|16169070
SNAP29 CEDNIK | FLJ21051 | SNAP-29 synaptosomal-associated蛋白质,29 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 9852078
STX1A HPC-1 | STX1 | p35-1 突触融合蛋白1(大脑) 重新组成复杂 BioGRID 10100611
STX8 碳水化合物 突触融合蛋白8 - - - - - - HPRD 11101518
STXBP1 EIEE4 | MUNC18-1 | UNC18 | hUNC18 | rbSec1 突触融合蛋白结合蛋白1 亲和力Capture-Western
重新组成复杂		 BioGRID 7553862|7768895
|10449403|12093152
|12963086
STXBP1 EIEE4 | MUNC18-1 | UNC18 | hUNC18 | rbSec1 突触融合蛋白结合蛋白1 - - - - - - HPRD 9045631
STXBP2 Hunc18b | MUNC18-2 | UNC18-2 | UNC18B | pp10122 突触融合蛋白结合蛋白2 - - - - - - HPRD, BioGRID 7768895|9045631
STXBP5 FLJ30922 | LGL3 | LLGL3 | MGC141942 | MGC141968 | Nbla04300 突触融合蛋白结合蛋白5 (tomosyn) - - - - - - HPRD, BioGRID 9620695
STXBP6 FLJ39638 | HSPC156 | amisyn 突触融合蛋白结合蛋白6 (amisyn) - - - - - - HPRD 12145319
SYP - - - - - - synaptophysin 亲和力Capture-Western BioGRID 7553862
SYT1 DKFZp781D2042 | P65 | SVP65 | SYT synaptotagmin我 - - - - - - HPRD, BioGRID 9010211
SYT4 HsT1192 | KIAA1342 synaptotagmin四世 - - - - - - HPRD 10397765
SYT7 IPCA-7 | MGC150517 | PCANAP7 | SYT-VII synaptotagmin七世 - - - - - - HPRD 7791877
SYTL4 DKFZp451P0116 | FLJ40960 | SLP4 synaptotagmin-like 4 - - - - - - HPRD, BioGRID 12101244
TRDMT1 DNMT2 | M。HsaIIP | PuMet | RNMT1 tRNA天冬氨酸甲基转移酶1 2台混合动力 BioGRID 16169070
TXLNA DKFZp451J0118 | IL14 | MGC118870 | MGC118871 | rp4 - 622 l5.4 | TXLN taxilinα 重新组成复杂 BioGRID 12558796
TXLNB C6orf198 | DKFZp451A175 | LST001 | MDP77 | dJ522B19.2 taxilinβ - - - - - - HPRD, BioGRID 15184072
UNC13B MGC133279 | MGC133280 | MUNC13 | UNC13 | Unc13h2 | hmunc13 unc-13同族体B(秀丽隐杆线虫) - - - - - - HPRD, BioGRID 8999968
VAMP1 DKFZp686H12131 | SYB1 | VAMP-1 vesicle-associated膜蛋白1 (synaptobrevin 1) 2台混合动力 BioGRID 12093152
VAMP2 FLJ11460 | SYB2 | VAMP-2 vesicle-associated膜蛋白2 (synaptobrevin 2) 亲和力Capture-Western
Co-crystal结构
西部
重新组成复杂
2台混合动力		 BioGRID 7553862|9030619
|10100611|10449403
|11832227|12093152
VAMP7 SYBL1 | TI-VAMP | VAMP-7 vesicle-associated膜蛋白7 - - - - - - HPRD, BioGRID 12853575
VAMP8 教育局 vesicle-associated膜蛋白8 (endobrevin) - - - - - - HPRD, BioGRID 11112705
VAPB ALS8 | VAMP-B | VAMP-C | VAP-B | VAP-C 鞋面(vesicle-associated膜蛋白)相关蛋白B和C 重新组成复杂 BioGRID 12651853
VIM FLJ36605 波形蛋白 2台混合动力 BioGRID 16169070
VPS11 END1 | PEP5 | RNF108 | hVPS11 空泡的蛋白分类11同族体(酵母) VPS11与STX1A (Syntaxin-1)。这种交互是仿照人类VPS11之间的交互和STX1A (Syntaxin-1)从一个未指明的物种。 绑定 14623309
VPS18 KIAA1475 | PEP3 空泡的蛋白分类18同族体(酵母) VPS18与STX1A (Syntaxin-1)。这种交互是仿照人类VPS18之间的交互和STX1A (Syntaxin-1)从一个未指明的物种。 绑定 14623309


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
膜泡运输KEGG网罗交互 38 25 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME肉毒神经毒性 19 14 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME蛋白水解乳沟网罗复杂的蛋白质 17 12 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME谷氨酸神经递质释放周期 15 13 所有SZGR 2.0基因通路
在化学突触REACTOME传输 186年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME神经系统 279年 221年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME神经递质释放周期 34 30. 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME能量代谢的集成 120年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME多巴胺神经递质释放周期 11 11 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME乙酰胆碱神经递质释放周期 10 9 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME糖尿病的途径 133年 91年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME去甲肾上腺素神经递质释放周期 10 10 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME胰岛素合成和处理 21 15 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME调节胰岛素分泌 93年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GABA合成释放再吸收和降解 17 16 所有SZGR 2.0基因通路
SENESE HDAC3目标了 501年 327年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力 811年 508年 所有SZGR 2.0基因通路
费雷拉尤因肉瘤不稳定和稳定 167年 92年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 398年 262年 所有SZGR 2.0基因通路
VANTVEER乳腺癌转移DN 121年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
HOEGERKORP CD44的直接目标 27 21 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
击倒老化肌肉了 244年 165年 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗CREB1目标了 One hundred. 72年 所有SZGR 2.0基因通路
《图片报》极品致癌签名 261年 166年 所有SZGR 2.0基因通路
马森FOXP3如果绑定 1229年 713年 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
霍夫曼小BII以前不成熟的B淋巴细胞DN 50 33 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 756年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 682年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍CALB1 CORR 548年 370年 所有SZGR 2.0基因通路
DN WIERENGA STAT5A目标 213年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
通过AKT1 BHAT ESR1目标 281年 183年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 133 421年 427年 m8 hsa - mir - 133 a UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU
hsa - mir - 133 b UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA
miR-15/16/195/424/497 441年 447年 m8 hsa-miR-15a大脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
hsa-miR-16大脑 UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
hsa-miR-15b大脑 UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
hsa - mir - 195深圳 UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
hsa - mir - 424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
hsa - mir - 497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir - 200 bc / 429 879年 885年 m8 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
mir - 217 876年 883年 1、m8 hsa - mir - 217 UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU
miR-29 438年 444年 m8 hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
mir - 490 451年 457年 1 hsa - mir - 490 CAACCUGGAGGACUCCAUGCUG
miR-9 1127年 1133年 m8 hsa-miR-9深圳 UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA