基因页：STX4
概括？
| 基因 | 6810 |
| 象征 | STX4 |
| 同义词 | STX4A | P35-2 |
| 描述 | 语法4 |
| 参考 | MIM：186591|HGNC：HGNC：11439|Ensembl：ENSG00000103496|HPRD：01722|Vega：Otthumg00000132404 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p11.2 |
| Pascal P值 | 0.31 |
| Sherlock P值 | 0.009 |
| 胎儿β | -0.392 |
| 主持人 | 小脑 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 元 |
| 支持 | 胞吞作用 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.015 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DOCK2 | 0.84 | 0.76 |
| CD68 | 0.84 | 0.73 |
| ITGB2 | 0.83 | 0.77 |
| NCKAP1L | 0.83 | 0.75 |
| HCK | 0.82 | 0.69 |
| SIGLEC10 | 0.79 | 0.71 |
| LCP1 | 0.79 | 0.71 |
| CX3CR1 | 0.78 | 0.78 |
| CSF1R | 0.77 | 0.79 |
| sash3 | 0.77 | 0.61 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.27 | -0.33 |
| FXYD1 | -0.27 | -0.30 |
| CXCL14 | -0.27 | -0.26 |
| MT1G | -0.26 | -0.30 |
| S100A13 | -0.26 | -0.26 |
| myl3 | -0.25 | -0.27 |
| AC098691.2 | -0.25 | -0.31 |
| AF347015.18 | -0.25 | -0.30 |
| CSAG1 | -0.25 | -0.29 |
| AF347015.21 | -0.25 | -0.29 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005484 | SNAP受体活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元，神经递质（GO期限：5） | - |
| 去：0006886 | 细胞内蛋白转运 | IEA | - | |
| GO：0016192 | 囊泡介导的运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 10856305 | |
| 去：0005773 | 液泡 | 塔斯 | 16339081 | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 18029348 | |
| GO：0016323 | 基底外侧质膜 | 艾达 | 16339081 | |
| GO：0031012 | 细胞外基质 | 艾达 | 18029348 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 纳帕 | Snapa | N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白，α | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 16189514 |
| NSF | SKD2 | N-乙基马来酰亚胺敏感因子 | - | HPRD | 8973549 |
| Rab11a | MGC1490 |YL8 | Rab11a，Ras Oncogene家族成员 | - | HPRD | 12435603 |
| Rab4a | HRES-1/RAB4 |rab4 | Rab4a，Ras Oncogene家族成员 | - | HPRD，Biogrid | 11063739 |
| Rab5a | rab5 | Rab5a，Ras Oncogene家族成员 | - | HPRD，Biogrid | 11884531 |
| 9月5日 | cdcrel |CDCREL-1 |CDCREL1 |H5 |pnutl1 | 9月5日 | - | HPRD，Biogrid | 11880646 |
| snap23 | HST17016 |snap23a |snap23b | 突触小体相关蛋白，23KDA | - | HPRD，Biogrid | 9168999 |
| snap25 | FLJ23079 |RIC-4 |Ric4 |sec9 |快照|Snap-25 |BA416N4.2 |DJ1068F16.2 | 突触小体相关蛋白，25KDA | - | HPRD | 8760387 |
| snap25 | FLJ23079 |RIC-4 |Ric4 |sec9 |快照|Snap-25 |BA416N4.2 |DJ1068F16.2 | 突触小体相关蛋白，25KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 7768895|8663154 |9852078|10194441 |
| snap29 | Cednik |FLJ21051 |SNAP-29 | 突触体相关蛋白，29KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 9852078 |
| STXBP1 | EIEE4 |munc18-1 |UNC18 |Hunc18 |RBSEC1 | 语法素结合蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 7768895|12773094 |
| STXBP2 | Hunc18b |munc18-2 |UNC18-2 |UNC18B |PP10122 | 语法素结合蛋白2 | 重构的复合物 | Biogrid | 7768895 |
| STXBP3 | munc18-3 |munc18c |PSP |UNC-18C | 语法素结合蛋白3 | - | HPRD | 10194441 |
| STXBP3 | munc18-3 |munc18c |PSP |UNC-18C | 语法素结合蛋白3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 12773094|12832401 |
| STXBP4 | FLJ16496 |MGC149829 |MGC50337 |synip | 语法结合蛋白4 | - | HPRD | 10394363|12855681 |
| STXBP5 | FLJ30922 |lgl3 |llgl3 |MGC141942 |MGC141968 |NBLA04300 | 语法素结合蛋白5（tomosyn） | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12832401 |
| STXBP6 | FLJ39638 |HSPC156 |Amisyn | 语法素结合蛋白6（AMISYN） | - | HPRD | 12145319 |
| SYT1 | DKFZP781D2042 |p65 |SVP65 |Syt | Synaptotagmin i | 重构的复合物 | Biogrid | 10397765 |
| SYT4 | HST1192 |KIAA1342 | Synaptotagmin IV | - | HPRD | 10397765 |
| SYT7 | IPCA-7 |MGC150517 |PCANAP7 |Syt-VII | Synaptotagmin VII | - | HPRD | 7791877 |
| txlna | DKFZP451J0118 |IL14 |MGC118870 |MGC118871 |RP4-622L5.4 |txln | 出租车alpha | 重构的复合物 | Biogrid | 12558796 |
| txlnb | C6orf198 |DKFZP451A175 |LST001 |MDP77 |DJ522B19.2 | 出租车β | - | HPRD，Biogrid | 15184072 |
| VAMP1 | DKFZP686H12131 |SYB1 |VAMP-1 | 囊泡相关的膜蛋白1（突触纤维1） | 两个杂交 | Biogrid | 8760387 |
| VAMP2 | FLJ11460 |SYB2 |VAMP-2 | 囊泡相关的膜蛋白2（突触纤维2） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 8760387|10194441 |10820264|12517971 |
| VAMP2 | FLJ11460 |SYB2 |VAMP-2 | 囊泡相关的膜蛋白2（突触纤维2） | - | HPRD | 8760387|12417022 |12517971 | 8770861 |
| VAMP3 | CEB | 囊泡相关的膜蛋白3（Cellubrevin） | - | HPRD，Biogrid | 12130530 |
| VAMP4 | VAMP24 | 囊泡相关的膜蛋白4 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| VAMP7 | Sybl1 |ti-vamp |VAMP-7 | 囊泡相关的膜蛋白7 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12853575 |
| VAMP8 | EDB | 囊泡相关的膜蛋白8（内折） | - | HPRD，Biogrid | 10820264 |
| VAPB | ALS8 |VAMP-B |vamp-c |VAP-B |VAP-C | VAMP（囊泡相关膜蛋白）相关蛋白B和C | 重构的复合物 | Biogrid | 12651853 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 囊泡运输中的kegg圈圈相互作用 | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG加压素调节的水重吸收 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin稳定途径 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID胰岛素葡萄糖途径 | 26 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肉毒杆菌神经毒性 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 | 60 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组的蛋白水解裂解，裂解复合蛋白 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对血小板胞质CA2升高的反应组反应 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔卡拉凋亡 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kayo卡路里限制肌肉 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村转移 | 47 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村转移模型 | 45 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-199 | 104 | 110 | M8 | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
| HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||