基因页:STXBP3
Summary?
基因ID | 6814 |
象征 | STXBP3 |
同义词 | munc18-3 | munc18c | psp | unc-18c |
描述 | 语法素结合蛋白3 |
参考 | MIM:608339|HGNC:HGNC:11446|ENSEMBL:ENSG00000116266|HPRD:10517|Vega:Otthumg0000000011122 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p13.3 |
Pascal P值 | 0.298 |
Sherlock P值 | 0.517 |
胎儿β | -1.128 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | canabinoid 多巴胺 胞吞作用 代谢性谷氨酸受体 5 -羟色胺 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS COMPOSITESET |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06527153 | 1 | 109289113 | STXBP3 | 5.21E-8 | -0.007 | 1.37E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6599250 | CHR3 | 38784028 | STXBP3 | 6814 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/STXBP3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
补充说明:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
补充说明:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TMEM130 | 0.93 | 0.96 |
MFSD4 | 0.91 | 0.86 |
SYN1 | 0.90 | 0.95 |
SV2B | 0.90 | 0.93 |
AK5 | 0.89 | 0.85 |
MAP2K1 | 0.89 | 0.93 |
EPDR1 | 0.89 | 0.89 |
Serinc3 | 0.89 | 0.92 |
是的 | 0.89 | 0.91 |
AGBL4 | 0.89 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.51 | -0.57 |
C9orf46 | -0.46 | -0.42 |
FAM36A | -0.44 | -0.32 |
GTF3C6 | -0.44 | -0.39 |
C21orf57 | -0.43 | -0.40 |
RBMX2 | -0.43 | -0.43 |
RPL23A | -0.43 | -0.44 |
rps19p3 | -0.42 | -0.47 |
SH3BP2 | -0.42 | -0.41 |
Dynlt1 | -0.42 | -0.45 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
DDX20 | DKFZP434H052 |DP103 |双子座3 | 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽20 | - | HPRD | 12065586 |
双子座4 | DKFZP434B131 |DKFZP434D174 |HC56 |HCAP1 |HHRF-1 |P97 | 宝石(核管细胞器)相关蛋白4 | - | HPRD | 12065586 |
双子座5 | DKFZP586M1824 |MGC142174 | 宝石(核管细胞器)相关蛋白5 | - | HPRD | 12065586 |
prkca | AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca | 蛋白激酶C,α | - | HPRD | 10194441 |
prkcsh | Age-R2 |G19P1 |PCLD |PLD1 | 蛋白激酶C底物80K-H | Prkcsh(80k-H)与STXBP3(MUNC18C)相互作用。这种相互作用是在人类80K-H和仓鼠MUNC18C之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15707389 |
SIP1 | gemin2 |sip1-delta | 运动神经元蛋白相互作用蛋白1的存活率1 | - | HPRD | 12065586 |
SMN1 | BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 | 运动神经元1,端粒的生存 | - | HPRD | 12065586 |
snap23 | HST17016 |snap23a |snap23b | synaptosomal-associated protein, 23kDa | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12773094 |
SNRPB | 鳕鱼|SNRPB1 |SMB/SMB'|snrnp-b | small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 | - | HPRD | 12065586 |
SNRPD2 | SMD2 |SNRPD1 | 小核核糖核蛋白D2多肽16.5KDA | - | HPRD | 12065586 |
SNRPD3 | SMD3 | 小核核糖核蛋白D3多肽18KDA | - | HPRD | 12065586 |
SNTG1 | g1syn |SYN4 | Syntrophin,伽马1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12832401 |
STX2 | EPIM |EPM |MGC51014 |STX2A |STX2B |STX2C | 语法2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12773094 |
STX4 | STX4A |P35-2 | 语法4 | - | HPRD | 10194441 |
STX4 | STX4A |P35-2 | 语法4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Two-hybrid |
Biogrid | 12773094|12832401 |
STXBP2 | Hunc18b |munc18-2 |UNC18-2 |UNC18B |PP10122 | 语法素结合蛋白2 | - | HPRD | 12065586 |
VAMP2 | FLJ11460 |SYB2 |VAMP-2 | 囊泡相关的膜蛋白2(突触纤维2) | 重构的复合物 | Biogrid | 12832401 |