Summary
基因ID 6814
象征 STXBP3
同义词 munc18-3 | munc18c | psp | unc-18c
描述 语法素结合蛋白3
参考 MIM:608339|HGNC:HGNC:11446|ENSEMBL:ENSG00000116266|HPRD:10517|Vega:Otthumg0000000011122
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p13.3
Pascal P值 0.298
Sherlock P值 0.517
胎儿β -1.128
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 canabinoid
多巴胺
胞吞作用
代谢性谷氨酸受体
5 -羟色胺
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
COMPOSITESET

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06527153 1 109289113 STXBP3 5.21E-8 -0.007 1.37E-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6599250 CHR3 38784028 STXBP3 6814 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

补充说明:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

补充说明:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TMEM130 0.93 0.96
MFSD4 0.91 0.86
SYN1 0.90 0.95
SV2B 0.90 0.93
AK5 0.89 0.85
MAP2K1 0.89 0.93
EPDR1 0.89 0.89
Serinc3 0.89 0.92
是的 0.89 0.91
AGBL4 0.89 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.51 -0.57
C9orf46 -0.46 -0.42
FAM36A -0.44 -0.32
GTF3C6 -0.44 -0.39
C21orf57 -0.43 -0.40
RBMX2 -0.43 -0.43
RPL23A -0.43 -0.44
rps19p3 -0.42 -0.47
SH3BP2 -0.42 -0.41
Dynlt1 -0.42 -0.45

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
DDX20 DKFZP434H052 |DP103 |双子座3 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽20 - HPRD 12065586
双子座4 DKFZP434B131 |DKFZP434D174 |HC56 |HCAP1 |HHRF-1 |P97 宝石(核管细胞器)相关蛋白4 - HPRD 12065586
双子座5 DKFZP586M1824 |MGC142174 宝石(核管细胞器)相关蛋白5 - HPRD 12065586
prkca AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca 蛋白激酶C,α - HPRD 10194441
prkcsh Age-R2 |G19P1 |PCLD |PLD1 蛋白激酶C底物80K-H Prkcsh(80k-H)与STXBP3(MUNC18C)相互作用。这种相互作用是在人类80K-H和仓鼠MUNC18C之间的相互作用上建模的。 绑定 15707389
SIP1 gemin2 |sip1-delta 运动神经元蛋白相互作用蛋白1的存活率1 - HPRD 12065586
SMN1 BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 运动神经元1,端粒的生存 - HPRD 12065586
snap23 HST17016 |snap23a |snap23b synaptosomal-associated protein, 23kDa 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12773094
SNRPB 鳕鱼|SNRPB1 |SMB/SMB'|snrnp-b small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 - HPRD 12065586
SNRPD2 SMD2 |SNRPD1 小核核糖核蛋白D2多肽16.5KDA - HPRD 12065586
SNRPD3 SMD3 小核核糖核蛋白D3多肽18KDA - HPRD 12065586
SNTG1 g1syn |SYN4 Syntrophin,伽马1 重构的复合物 Biogrid 12832401
STX2 EPIM |EPM |MGC51014 |STX2A |STX2B |STX2C 语法2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12773094
STX4 STX4A |P35-2 语法4 - HPRD 10194441
STX4 STX4A |P35-2 语法4 亲和力捕获 - 韦斯特恩
Two-hybrid
Biogrid 12773094|12832401
STXBP2 Hunc18b |munc18-2 |UNC18-2 |UNC18B |PP10122 语法素结合蛋白2 - HPRD 12065586
VAMP2 FLJ11460 |SYB2 |VAMP-2 囊泡相关的膜蛋白2(突触纤维2) 重构的复合物 Biogrid 12832401


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
反应组止血 466 331 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向DN 384 230 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
王攀登目标DN 186 114 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌 404 246 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Appierto对Fenretinide的反应 38 26 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Schlosser血清反应DN 712 443 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
buytaert光动力疗法压力 811 508 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Shen Smarca2目标 424 268 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Ramalho Stemness 206 118 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Sesto对UV C2的反应 54 39 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2 DN 830 547 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Kayo衰老的肌肉 244 165 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Lee衰老的新皮层 89 59 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
外邦紫外线高剂量DN 312 203 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
外邦紫外线响应集群D1 18 13 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
伯顿成生成9 92 59 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Stearman肺癌早期与晚期 125 89 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Mueller Plurinet 299 189 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Frasor对Serm或Fulvestrant的反应 24 14 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
陈代谢综合征网络 1210 725 所有SZGR 2。0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 所有SZGR 2。0 genes in this pathway