概括
基因 6819
象征 sult1c2
同义词 ST1C1 | ST1C2 | SULT1C1 | HUMSULTC2
描述 硫代转移酶家族1C成员2
参考 MIM:602385|HGNC:HGNC:11456|Ensembl:ENSG00000198203|HPRD:03858|Vega:Otthumg00000153215
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q12.3
Pascal P值 0.02
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00755

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 sult1c2 6819 0.14 反式
RS12617332 2 108886551 sult1c2 ENSG00000198203.5 1.922E-8 0 -18544 gtex_brain_ba24
RS13003461 2 108889658 sult1c2 ENSG00000198203.5 1.697E-8 0 -15437 gtex_brain_ba24
RS6760918 2 108904340 sult1c2 ENSG00000198203.5 5.068e-13 0 -755 gtex_brain_ba24
RS2305484 2 108905030 sult1c2 ENSG00000198203.5 2.581E-6 0 -65 gtex_brain_ba24
RS2305485 2 108905048 sult1c2 ENSG00000198203.5 4.058e-11 0 -47 gtex_brain_ba24
RS10173554 2 108907361 sult1c2 ENSG00000198203.5 2.106E-7 0 2266 gtex_brain_ba24
RS13424530 2 108909401 sult1c2 ENSG00000198203.5 2.106E-7 0 4306 gtex_brain_ba24
RS17036061 2 108911809 sult1c2 ENSG00000198203.5 2.106E-7 0 6714 gtex_brain_ba24
RS36055322 2 108911904 sult1c2 ENSG00000198203.5 2.106E-7 0 6809 gtex_brain_ba24
RS13410305 2 108912673 sult1c2 ENSG00000198203.5 4.931E-8 0 7578 gtex_brain_ba24
RS12104590 2 108913012 sult1c2 ENSG00000198203.5 2.897E-9 0 7917 gtex_brain_ba24
RS4149420 2 108913090 sult1c2 ENSG00000198203.5 4.979E-8 0 7995 gtex_brain_ba24
RS4149423 2 108916044 sult1c2 ENSG00000198203.5 2.877E-9 0 10949 gtex_brain_ba24
RS12620050 2 108919798 sult1c2 ENSG00000198203.5 1.375E-6 0 14703 gtex_brain_ba24
RS2198466 2 108926967 sult1c2 ENSG00000198203.5 1.658E-6 0 21872 gtex_brain_ba24
RS4676194 2 108928082 sult1c2 ENSG00000198203.5 4.451E-7 0 22987 gtex_brain_ba24
RS6723274 2 108884790 sult1c2 ENSG00000198203.5 9.318e-7 0 -20305 gtex_brain_putamen_basal
RS13024169 2 108885125 sult1c2 ENSG00000198203.5 5.089E-6 0 -19970 gtex_brain_putamen_basal
RS6542758 2 108885748 sult1c2 ENSG00000198203.5 4.432E-6 0 -19347 gtex_brain_putamen_basal
RS12617332 2 108886551 sult1c2 ENSG00000198203.5 4.696E-8 0 -18544 gtex_brain_putamen_basal
RS13003461 2 108889658 sult1c2 ENSG00000198203.5 8.498e-8 0 -15437 gtex_brain_putamen_basal
RS6760918 2 108904340 sult1c2 ENSG00000198203.5 4.95e-13 0 -755 gtex_brain_putamen_basal
RS2305484 2 108905030 sult1c2 ENSG00000198203.5 1.091E-7 0 -65 gtex_brain_putamen_basal
RS2305485 2 108905048 sult1c2 ENSG00000198203.5 4.017E-10 0 -47 gtex_brain_putamen_basal
RS10173554 2 108907361 sult1c2 ENSG00000198203.5 9.039e-7 0 2266 gtex_brain_putamen_basal
RS13424530 2 108909401 sult1c2 ENSG00000198203.5 9.039e-7 0 4306 gtex_brain_putamen_basal
RS17036061 2 108911809 sult1c2 ENSG00000198203.5 9.039e-7 0 6714 gtex_brain_putamen_basal
RS36055322 2 108911904 sult1c2 ENSG00000198203.5 9.039e-7 0 6809 gtex_brain_putamen_basal
RS13410305 2 108912673 sult1c2 ENSG00000198203.5 5.938e-10 0 7578 gtex_brain_putamen_basal
RS12104590 2 108913012 sult1c2 ENSG00000198203.5 5.981E-10 0 7917 gtex_brain_putamen_basal
RS4149420 2 108913090 sult1c2 ENSG00000198203.5 5.947E-10 0 7995 gtex_brain_putamen_basal
RS4149423 2 108916044 sult1c2 ENSG00000198203.5 5.934e-12 0 10949 gtex_brain_putamen_basal
RS12620050 2 108919798 sult1c2 ENSG00000198203.5 1.695E-10 0 14703 gtex_brain_putamen_basal
RS2198466 2 108926967 sult1c2 ENSG00000198203.5 2.94E-9 0 21872 gtex_brain_putamen_basal
RS4676194 2 108928082 sult1c2 ENSG00000198203.5 9.336e-11 0 22987 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008146 硫代转移酶活性 塔斯 9169148
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009308 细胞胺代谢过程 塔斯 9169148
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005856 细胞骨架 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 塔斯 9169148

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组生物氧化 139 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组胞质硫化 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome II期结合 70 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vecchi胃癌先进与早期DN 138 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
障碍结肠癌复发 42 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
aung胃癌 54 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
帕特森多西他赛电阻 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cervera SDHB目标2 114 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟 114 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavazoie转移 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞DN 76 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUMI HNF4A目标 34 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因