基因页:sult1c2
概括?
基因 | 6819 |
象征 | sult1c2 |
同义词 | ST1C1 | ST1C2 | SULT1C1 | HUMSULTC2 |
描述 | 硫代转移酶家族1C成员2 |
参考 | MIM:602385|HGNC:HGNC:11456|Ensembl:ENSG00000198203|HPRD:03858|Vega:Otthumg00000153215 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q12.3 |
Pascal P值 | 0.02 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0004 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00755 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | sult1c2 | 6819 | 0.14 | 反式 | ||
RS12617332 | 2 | 108886551 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 1.922E-8 | 0 | -18544 | gtex_brain_ba24 |
RS13003461 | 2 | 108889658 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 1.697E-8 | 0 | -15437 | gtex_brain_ba24 |
RS6760918 | 2 | 108904340 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 5.068e-13 | 0 | -755 | gtex_brain_ba24 |
RS2305484 | 2 | 108905030 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 2.581E-6 | 0 | -65 | gtex_brain_ba24 |
RS2305485 | 2 | 108905048 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 4.058e-11 | 0 | -47 | gtex_brain_ba24 |
RS10173554 | 2 | 108907361 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 2.106E-7 | 0 | 2266 | gtex_brain_ba24 |
RS13424530 | 2 | 108909401 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 2.106E-7 | 0 | 4306 | gtex_brain_ba24 |
RS17036061 | 2 | 108911809 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 2.106E-7 | 0 | 6714 | gtex_brain_ba24 |
RS36055322 | 2 | 108911904 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 2.106E-7 | 0 | 6809 | gtex_brain_ba24 |
RS13410305 | 2 | 108912673 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 4.931E-8 | 0 | 7578 | gtex_brain_ba24 |
RS12104590 | 2 | 108913012 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 2.897E-9 | 0 | 7917 | gtex_brain_ba24 |
RS4149420 | 2 | 108913090 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 4.979E-8 | 0 | 7995 | gtex_brain_ba24 |
RS4149423 | 2 | 108916044 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 2.877E-9 | 0 | 10949 | gtex_brain_ba24 |
RS12620050 | 2 | 108919798 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 1.375E-6 | 0 | 14703 | gtex_brain_ba24 |
RS2198466 | 2 | 108926967 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 1.658E-6 | 0 | 21872 | gtex_brain_ba24 |
RS4676194 | 2 | 108928082 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 4.451E-7 | 0 | 22987 | gtex_brain_ba24 |
RS6723274 | 2 | 108884790 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 9.318e-7 | 0 | -20305 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13024169 | 2 | 108885125 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 5.089E-6 | 0 | -19970 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6542758 | 2 | 108885748 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 4.432E-6 | 0 | -19347 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12617332 | 2 | 108886551 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 4.696E-8 | 0 | -18544 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13003461 | 2 | 108889658 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 8.498e-8 | 0 | -15437 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6760918 | 2 | 108904340 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 4.95e-13 | 0 | -755 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2305484 | 2 | 108905030 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 1.091E-7 | 0 | -65 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2305485 | 2 | 108905048 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 4.017E-10 | 0 | -47 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10173554 | 2 | 108907361 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 9.039e-7 | 0 | 2266 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13424530 | 2 | 108909401 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 9.039e-7 | 0 | 4306 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17036061 | 2 | 108911809 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 9.039e-7 | 0 | 6714 | gtex_brain_putamen_basal |
RS36055322 | 2 | 108911904 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 9.039e-7 | 0 | 6809 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13410305 | 2 | 108912673 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 5.938e-10 | 0 | 7578 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12104590 | 2 | 108913012 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 5.981E-10 | 0 | 7917 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4149420 | 2 | 108913090 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 5.947E-10 | 0 | 7995 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4149423 | 2 | 108916044 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 5.934e-12 | 0 | 10949 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12620050 | 2 | 108919798 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 1.695E-10 | 0 | 14703 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2198466 | 2 | 108926967 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 2.94E-9 | 0 | 21872 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4676194 | 2 | 108928082 | sult1c2 | ENSG00000198203.5 | 9.336e-11 | 0 | 22987 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SULT1C2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008146 | 硫代转移酶活性 | 塔斯 | 9169148 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009308 | 细胞胺代谢过程 | 塔斯 | 9169148 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 9169148 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组胞质硫化 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome II期结合 | 70 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vecchi胃癌先进与早期DN | 138 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
障碍结肠癌复发 | 42 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 | 143 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
aung胃癌 | 54 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
帕特森多西他赛电阻 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cervera SDHB目标2 | 114 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lenaour树突状细胞成熟 | 114 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔衰老肾脏无血DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tavazoie转移 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌干细胞DN | 76 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SUMI HNF4A目标 | 34 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向DN | 109 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |