基因页：ABCC8
概括？
| 基因 | 6833 |
| 象征 | ABCC8 |
| 同义词 | abc36 | hhf1 | hi | hrins | mrp8 | phhi | sur1 | sur1delta2 | tndm2 |
| 描述 | ATP绑定盒子亚家族成员8 |
| 参考 | MIM：600509|HGNC：HGNC：59|ENSEMBL：ENSG00000006071|HPRD：02741|Vega：Otthumg00000166316 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11P15.1 |
| Pascal P值 | 0.001 |
| Sherlock P值 | 0.887 |
| 胎儿β | -1.774 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | ABCC8 | 6833 | 0.14 | 反式 | ||
| RS4148600 | 11 | 17496964 | ABCC8 | ENSG00000006071.7 | 1.37991E-6 | 0.01 | 1485 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS985136 | 11 | 17497794 | ABCC8 | ENSG00000006071.7 | 3.77553E-7 | 0.01 | 655 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Zmym4 | 0.97 | 0.98 |
| WDR3 | 0.97 | 0.98 |
| Vezt | 0.96 | 0.96 |
| scyl2 | 0.96 | 0.97 |
| 帕帕尔格 | 0.96 | 0.97 |
| KIAA1430 | 0.96 | 0.96 |
| Zmym2 | 0.96 | 0.96 |
| dis3 | 0.96 | 0.96 |
| NCBP1 | 0.96 | 0.97 |
| DHX57 | 0.95 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.79 | -0.90 |
| MT-CO2 | -0.79 | -0.89 |
| HLA-F | -0.78 | -0.82 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.87 |
| AF347015.33 | -0.78 | -0.87 |
| ifi27 | -0.77 | -0.88 |
| AIFM3 | -0.76 | -0.79 |
| S100B | -0.76 | -0.83 |
| AF347015.27 | -0.76 | -0.85 |
| higd1b | -0.75 | -0.88 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG ABC转运蛋白 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG II型糖尿病 | 47 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID HNF3B途径 | 45 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 能量代谢的反应组整合 | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome ABC家族蛋白介导的运输 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胰岛素分泌的反应组调节 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组向内纠正K通道 | 31 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heidenblad Amplicon 12p11 12 | 33 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| nguyen Notch1靶向 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nutt GBM与AO Glioma DN | 45 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合 | 67 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 角色glis3目标 | 37 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lim乳腺腔内成熟 | 116 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |