概括
基因 6837
象征 Med22
同义词 Med24 | Surf5 | Surf-5
描述 中介复合体亚基22
参考 MIM:185641|HGNC:HGNC:11477|ENSEMBL:ENSG00000148297|HPRD:01713|Vega:Otthumg00000020869
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9q34.2
Pascal P值 0.308
Sherlock P值 0.008
胎儿β 0.717

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
不,不 0.96 0.93
Anp32a 0.95 0.92
KDM1 0.95 0.94
INTS7 0.95 0.94
FUBP1 0.95 0.95
XRN2 0.95 0.93
EIF4B 0.94 0.93
DHX9 0.94 0.95
MSH6 0.94 0.94
RBMX 0.94 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.70 -0.81
AF347015.31 -0.70 -0.91
FXYD1 -0.70 -0.92
AIFM3 -0.70 -0.81
TSC22D4 -0.70 -0.84
MT-CO2 -0.69 -0.91
AF347015.33 -0.69 -0.89
C5orf53 -0.69 -0.76
pth1r -0.69 -0.79
ifi27 -0.69 -0.90

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 来源 PubMed ID
GOLM1 C9orf155 |FLJ22634 |FLJ23608 |Golph2 |gp73 |PSEC0257 |BA379P1.3 高尔基膜蛋白1 两个杂交 Biogrid 16169070
Med10 L6 |MGC5309 |nut2 |TRG20 中介复合体亚基10 亲和力捕获ms Biogrid 12584197|15175163
MED11 HSPC296 |MGC88387 中介复合体亚基11 - HPRD,Biogrid 12584197
MED11 HSPC296 |MGC88387 中介复合体亚基11 Surf5与HSPC296相互作用。这种相互作用是在人类表面5和小鼠HSPC296之间的相互作用上建模的。 绑定 12584197
Med17 CRSP6 |CRSP77 |滴80 |FLJ10812 |陷阱80 中介复合体亚基17 TRAP80与Surf5相互作用。 绑定 12584197
Med19 DT2P1G7 |LCMR1 中介复合体亚基19 亲和力捕获ms Biogrid 15175163
Med25 酸1 |Arc92 |DKFZP434K0512 |MGC70671 |P78 |PTOV2 |TCBAP0758 中介复合体亚基25 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14638676
Med26 CRSP7 |CRSP70 中介复合体亚基26 亲和力捕获ms Biogrid 15175163
Med27 crap34 |CRSP34 |CRSP8 |MGC11274 |陷阱37 中介复合体亚基27 重构的复合物 Biogrid 12584197
Med27 crap34 |CRSP34 |CRSP8 |MGC11274 |陷阱37 中介复合体亚基27 TRAP37与Surf5相互作用。 绑定 12584197
Med28 1500003d12rik |DKFZP434N185 |EG1 |魔术 中介复合体亚基28 亲和力捕获ms Biogrid 15175163
Med29 DKFZP434H247 |ixl 中介复合体亚基29 - HPRD 14576168
Med29 DKFZP434H247 |ixl 中介复合体亚基29 亲和力捕获ms Biogrid 15175163
Med30 MGC9890 |thrap6 |陷阱25 中介复合体亚基30 - HPRD,Biogrid 12584197
Med30 MGC9890 |thrap6 |陷阱25 中介复合体亚基30 Surf5与TRAP25相互作用。这种相互作用是在人类表面5和小鼠陷阱25之间的相互作用上建模的。 绑定 12584197
Med7 CRSP33 |CRSP9 |MGC12284 中介复合体亚基7 重构的复合物 Biogrid 12584197
Med9 FLJ10193 |Med25 |MGC138234 中介复合体亚基9 - HPRD 14638676
Med9 FLJ10193 |Med25 |MGC138234 中介复合体亚基9 亲和力捕获ms Biogrid 15175163
thoc7 FLJ23445 |NIF3L1BP1 |FSAP24 Tho复合物7同源物(果蝇) 重构的复合物 Biogrid 12584197


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Ppara激活基因表达 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射4的响应4 61 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标需要MYC 210 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇2的时间反应2 86 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因