基因页:Med22
概括?
基因 | 6837 |
象征 | Med22 |
同义词 | Med24 | Surf5 | Surf-5 |
描述 | 中介复合体亚基22 |
参考 | MIM:185641|HGNC:HGNC:11477|ENSEMBL:ENSG00000148297|HPRD:01713|Vega:Otthumg00000020869 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9q34.2 |
Pascal P值 | 0.308 |
Sherlock P值 | 0.008 |
胎儿β | 0.717 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MED22_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
不,不 | 0.96 | 0.93 |
Anp32a | 0.95 | 0.92 |
KDM1 | 0.95 | 0.94 |
INTS7 | 0.95 | 0.94 |
FUBP1 | 0.95 | 0.95 |
XRN2 | 0.95 | 0.93 |
EIF4B | 0.94 | 0.93 |
DHX9 | 0.94 | 0.95 |
MSH6 | 0.94 | 0.94 |
RBMX | 0.94 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.70 | -0.81 |
AF347015.31 | -0.70 | -0.91 |
FXYD1 | -0.70 | -0.92 |
AIFM3 | -0.70 | -0.81 |
TSC22D4 | -0.70 | -0.84 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.91 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.89 |
C5orf53 | -0.69 | -0.76 |
pth1r | -0.69 | -0.79 |
ifi27 | -0.69 | -0.90 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
GOLM1 | C9orf155 |FLJ22634 |FLJ23608 |Golph2 |gp73 |PSEC0257 |BA379P1.3 | 高尔基膜蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Med10 | L6 |MGC5309 |nut2 |TRG20 | 中介复合体亚基10 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 12584197|15175163 |
MED11 | HSPC296 |MGC88387 | 中介复合体亚基11 | - | HPRD,Biogrid | 12584197 |
MED11 | HSPC296 |MGC88387 | 中介复合体亚基11 | Surf5与HSPC296相互作用。这种相互作用是在人类表面5和小鼠HSPC296之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 12584197 |
Med17 | CRSP6 |CRSP77 |滴80 |FLJ10812 |陷阱80 | 中介复合体亚基17 | TRAP80与Surf5相互作用。 | 绑定 | 12584197 |
Med19 | DT2P1G7 |LCMR1 | 中介复合体亚基19 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15175163 |
Med25 | 酸1 |Arc92 |DKFZP434K0512 |MGC70671 |P78 |PTOV2 |TCBAP0758 | 中介复合体亚基25 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14638676 |
Med26 | CRSP7 |CRSP70 | 中介复合体亚基26 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15175163 |
Med27 | crap34 |CRSP34 |CRSP8 |MGC11274 |陷阱37 | 中介复合体亚基27 | 重构的复合物 | Biogrid | 12584197 |
Med27 | crap34 |CRSP34 |CRSP8 |MGC11274 |陷阱37 | 中介复合体亚基27 | TRAP37与Surf5相互作用。 | 绑定 | 12584197 |
Med28 | 1500003d12rik |DKFZP434N185 |EG1 |魔术 | 中介复合体亚基28 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15175163 |
Med29 | DKFZP434H247 |ixl | 中介复合体亚基29 | - | HPRD | 14576168 |
Med29 | DKFZP434H247 |ixl | 中介复合体亚基29 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15175163 |
Med30 | MGC9890 |thrap6 |陷阱25 | 中介复合体亚基30 | - | HPRD,Biogrid | 12584197 |
Med30 | MGC9890 |thrap6 |陷阱25 | 中介复合体亚基30 | Surf5与TRAP25相互作用。这种相互作用是在人类表面5和小鼠陷阱25之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 12584197 |
Med7 | CRSP33 |CRSP9 |MGC12284 | 中介复合体亚基7 | 重构的复合物 | Biogrid | 12584197 |
Med9 | FLJ10193 |Med25 |MGC138234 | 中介复合体亚基9 | - | HPRD | 14638676 |
Med9 | FLJ10193 |Med25 |MGC138234 | 中介复合体亚基9 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15175163 |
thoc7 | FLJ23445 |NIF3L1BP1 |FSAP24 | Tho复合物7同源物(果蝇) | 重构的复合物 | Biogrid | 12584197 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Ppara激活基因表达 | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射4的响应4 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇2的时间反应2 | 86 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |