基因页：SYCP1

概括？
基因 6847
象征 SYCP1
同义词 ct8 | hom-tes-14 | scp-1 | scp1
描述 突触核复合蛋白1
参考 MIM：602162|HGNC：HGNC：11487|Ensembl：ENSG00000198765|HPRD：03698|Vega：Otthumg0000000012057
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1P13-P12
Pascal P值 0.019
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00814
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
STK32B 0.87 0.80
CCBE1 0.86 0.74
AKAP7 0.84 0.77
PROM1 0.83 0.74
L3MBTL3 0.83 0.79
nkain2 0.83 0.67
KLF6 0.82 0.78
axin2 0.82 0.79
RPRM 0.80 0.77
CSRP2 0.80 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM162A -0.56 -0.64
HLA-F -0.55 -0.69
AIFM3 -0.55 -0.68
aldoc -0.55 -0.66
REEP6 -0.55 -0.45
克鲁 -0.55 -0.66
TSC22D4 -0.54 -0.69
ACOT13 -0.54 -0.64
hepn1 -0.54 -0.66
FBXO2 -0.53 -0.64

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003677 DNA结合 塔斯 1464329
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 ISS 15944401
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007130 突发型复合体组件 IEA 突触（GO期限：11） -
去：0007130 突发型复合体组件 ISS 突触（GO期限：11） 15944401
去：0007131 相互减数分裂重组 塔斯 1464329
去：0007283 精子发生 塔斯 1464329
去：0007049 细胞周期 IEA -
去：0007126 减数分裂 IEA -
去：0051301 细胞分裂 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0000801 中心元素 IEA -
GO：0000802 横向灯丝 IEA -
去：0005634 核 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Reactome减数分裂 116 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Meiotic Synapsis 73 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su睾丸 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN 42 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
精子DN中的Weber甲基化HCP 28 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk减数分裂和DNA修复 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK精子细胞 72 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP与H3未甲基化 37 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 228 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Glis2靶向 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-186 320 327 1A，M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu