基因页：SYN1
概括？
| 基因 | 6853 |
| 象征 | SYN1 |
| 同义词 | Syn1a | Syn1b | Syni |
| 描述 | 突触i |
| 参考 | MIM：313440|HGNC：HGNC：11494|ENSEMBL：ENSG00000008056|HPRD：02433|Vega：Otthumg00000021454 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XP11.23 |
| 胎儿β | -1.521 |
| 支持 | canabinoid 多巴胺 胞吞作用 代谢性谷氨酸受体 5-羟色胺 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN g2cdb.human_synaptosom COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003824 | 催化活性 | IEA | - | |
| 去：0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0005215 | 转运蛋白活性 | 塔斯 | 2110562 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007269 | 神经递质分泌 | IEA | 神经元，轴突，突触，5-羟色胺，神经递质，多巴胺（GO期限：8） | - |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 2110562 |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008021 | 突触囊泡 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：12） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Amph | AMPH1 | 两亲动 | - | HPRD，Biogrid | 10899172 |
| Bin1 | amph2 |amphl |DKFZP547F068 |MGC10367 |SH3P9 | 桥接整合器1 | - | HPRD，Biogrid | 10899172 |
| CRK | crkii | V-CRK肉瘤病毒CT10 ONCOGENE同源物（Avian） | - | HPRD，Biogrid | 10899172 |
| GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD | 8022809 |
| GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD，Biogrid | 8022809 | 10899172 |
| Kat5 | esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 | K（赖氨酸）乙酰转移酶5 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| NCF1 | FLJ79451 |NCF1A |noxo2 |SH3PXD1A |p47phox | 中性粒细胞胞质因子1 | 体内 | Biogrid | 10899172 |
| NCF1C | SH3PXD1C | 中性粒细胞胞质因子1c假基因 | - | HPRD | 10899172 |
| NOS1 | IHPS1 |nos |nnos | 一氧化氮合酶1（神经元） | 重构的复合物 | Biogrid | 11867766 |
| nos1ap | 6330408p19rik |Capon |MGC138500 | 一氧化氮合酶1（神经元）衔接蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 11867766 |
| PFN2 | D3S1319E |PFL | profilin 2 | - | HPRD | 9463375 |
| PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶，调节亚基1（alpha） | - | HPRD，Biogrid | 10899172 |
| PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | 磷脂酶C，伽马1 | - | HPRD | 10899172 |
| rasa1 | CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP | Ras P21蛋白激活剂（GTPase激活蛋白）1 | - | HPRD，Biogrid | 10899172 |
| SH3GL2 | CNSA2 |een-b1 |FLJ20276 |FLJ25015 |SH3D2A |SH3P4 | SH3域grb2样2 | 重构的复合物 | Biogrid | 12456676 |
| SPTAN1 | （alpha）ii-spectrin |FLJ44613 |Neas | 光谱，α，非肉毒细胞1（阿尔法 - - - - - - - --------） | - | HPRD | 1905928 |
| src | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | V-SRC肉瘤（Schmidt-Ruppin A-2）病毒癌基因同源物（Avian） | - | HPRD，Biogrid | 10899172 |
| SYN1 | Syn1a |SYN1B |Syni | 突触i | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| SYN2 | Synii |Syriia |Syniib | 突触II | - | HPRD，Biogrid | 10358015 |
| SYN3 | - | 突触III | - | HPRD | 10358015 |
| vim | FLJ36605 | 波形蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经递质释放周期 | 34 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组多巴胺神经递质释放周期 | 11 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 敏锐的回应罗格列酮DN | 106 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VART KSHV感染血管生成标记 | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hunsberger运动调节基因 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-153 | 665 | 671 | 1a | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
| mir-19 | 696 | 703 | 1A，M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
| mir-448 | 664 | 671 | 1A，M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
| mir-452 | 667 | 673 | M8 | HSA-MIR-452 | UguuugcaggaaacugagaC |
| mir-539 | 58 | 65 | 1A，M8 | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |