基因页面:SYN2
总结吗?
| GeneID | 6854年 |
| 象征 | SYN2 |
| 同义词 | SYNII |
| 描述 | synapsin二世 |
| 参考 | MIM: 600755|HGNC: HGNC: 11495|运用:ENSG00000157152|HPRD: 02857|织女:OTTHUMG00000155335 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 p25 |
| 帕斯卡假定值 | 0.009 |
| 胎儿β | -2.159 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 |
| 支持 | CANABINOID 多巴胺 胞外分泌 5 -羟色胺 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_clathrin G2Cdb.human_Synaptosome |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 3 | 链接到SZGene |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:3 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs12633841 | 3 | 11630252 | SYN2 | ENSG00000157152.12 | 2.05327 e-6 | 0.04 | -415624年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TTC14 | 0.91 | 0.75 |
| GSDMB | 0.90 | 0.84 |
| WSB1 | 0.90 | 0.85 |
| AC015813.1 | 0.87 | 0.70 |
| CCDC84 | 0.86 | 0.82 |
| ZNF83 | 0.85 | 0.69 |
| SEC31B | 0.85 | 0.88 |
| AHSA2 | 0.85 | 0.80 |
| HPX | 0.84 | 0.64 |
| AC073995.1 | 0.84 | 0.53 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ITM2A | -0.35 | -0.42 |
| BSG | -0.34 | -0.22 |
| GIMAP5 | -0.34 | -0.36 |
| HLA-C | -0.34 | -0.28 |
| TM4SF18 | -0.33 | -0.35 |
| TM4SF1 | -0.33 | -0.34 |
| IGFBP7 | -0.32 | -0.39 |
| 抗原 | -0.32 | -0.31 |
| GIMAP6 | -0.32 | -0.31 |
| ELTD1 | -0.31 | -0.25 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003824 | 催化活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007269 | 神经递质分泌 | 国际能源机构 | Synap神经元,轴突,5 -羟色胺,多巴胺神经递质,(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0007268 | 突触传递 | 助教 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | 8964517 |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0030672 | 突触囊泡膜 | 国际能源机构 | Synap(术语层面:13) | - - - - - - |
| 去:0045202 | 突触 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | - - - - - - |
| 去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 在化学突触REACTOME传输 | 186年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经递质释放周期 | 34 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME多巴胺神经递质释放周期 | 11 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI分子武器VS erm | 332年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除 | 195年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆衰老的大脑DN | 153年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃长期造血干细胞 | 302年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王LSD1 DN的目标 | 39 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由喀斯特IWANAGA致癌PTEN DN | 353年 | 226年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑胶质母细胞瘤可塑性DN | 58 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 139 | 649年 | 655年 | 1 | hsa - mir - 139大脑 | UCUACAGUGCACGUGUCU |
| mir - 153 | 136年 | 142年 | m8 | hsa - mir - 153 | UUGCAUAGUCACAAAAGUGA |
| mir - 217 | 138年 | 144年 | m8 | hsa - mir - 217 | UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU |
| miR-25/32/92/363/367 | 798年 | 805年 | 1、m8 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA | ||||
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| miR-30-5p | 164年 | 170年 | m8 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir - 335 | 656年 | 662年 | m8 | hsa - mir - 335大脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUGU |
| mir - 338 | 2207年 | 2214年 | 1、m8 | hsa - mir - 338大脑 | UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA |
| miR-34/449 | 2016年 | 2023年 | 1、m8 | hsa-miR-34a大脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
| hsa-miR-34c | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
| hsa - mir - 449 | UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU | ||||
| hsa - mir - 449 b | AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC | ||||
| miR-34b | 1088年 | 1095年 | 1、m8 | hsa-miR-34b | UAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUG |
| mir - 378 * | 273年 | 279年 | m8 | hsa - mir - 422 b | CUGGACUUGGAGUCAGAAGGCC |
| hsa - mir - 422 a | CUGGACUUAGGGUCAGAAGGCC | ||||
| mir - 410 | 2277年 | 2283年 | m8 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir - 448 | 1707年 | 1713年 | m8 | hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
| mir - 542 - 3 - p | 2108年 | 2114年 | 1 | hsa - mir - 542 - 3 - p | UGUGACAGAUUGAUAACUGAAA |