基因页：SYT1

Summary？
基因 6857
象征 SYT1
同义词 P65 | SVP65 | SYT
描述 Synaptotagmin 1
参考 MIM：185605|HGNC：HGNC：11509|Ensembl：ENSG0000000067715|HPRD：01710|Vega：Otthumg00000134326
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12cen-Q21
Pascal P值 0.003
Sherlock P值 0.923
胎儿β -0.706
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 canabinoid
多巴胺
胞吞作用
代谢性谷氨酸受体
5-羟色胺
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_CLATHRIN
g2cdb.human_synaptosom
G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核
G2CDB.HUMANNRC
CompositeSet
Darnell FMRP目标
潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：5
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0024

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7132043 CHR12 80968399 SYT1 6857 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ACTR3 0.93 0.94
GSPT2 0.92 0.93
CCT6A 0.92 0.94
SKIV2L2 0.92 0.93
ARMCX1 0.92 0.92
SNX4 0.92 0.92
COPB1 0.92 0.91
PLAA 0.92 0.93
Rab10 0.92 0.93
MATR3 0.91 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.73 -0.85
MT-CO2 -0.73 -0.85
AF347015.33 -0.72 -0.84
AF347015.31 -0.71 -0.83
HLA-F -0.71 -0.79
ifi27 -0.70 -0.83
AF347015.27 -0.69 -0.81
AF347015.8 -0.69 -0.83
mt-cyb -0.68 -0.81
AF347015.2 -0.68 -0.85

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005543 磷脂结合 塔斯 1840599
去：0005545 磷脂酰肌醇结合 塔斯 11438518
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005215 转运蛋白活性 IEA -
去：0048306 钙依赖性蛋白结合 IEA -
GO：0017075 语法1结合 塔斯 11438518
GO：0050750 low-density lipoprotein receptor binding 艾达 15082773
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007269 神经递质分泌 塔斯 neuron, axon, Synap, serotonin, Neurotransmitter, dopamine (GO term level: 8) 11438518
去：0007268 突触传输 塔斯 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） 1840599
去：0005513 检测钙离子 塔斯 11438518
去：0006810 运输 IEA -
GO：0051260 蛋白质家庭化 塔斯 11438518
GO：0017157 调节胞吐作用 塔斯 11438518
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0042734 presynaptic membrane IEA 神经元，轴突，突触（GO术语级别：5） -
去：0043005 神经元投影 IEA 神经元，轴突，神经突，树突（GO期限：5） -
去：0030672 突触囊泡膜 IEA 突触（GO期限：13） -
GO：0045202 突触 IEA 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） -
去：0005737 细胞质 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
GO：0030054 细胞连接 IEA -
GO：0031410 细胞质囊泡 IEA -
去：0030141 分泌颗粒 IEA -
去：0030666 内吞囊泡膜 经验 2446925

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
C6orf15 STG 染色体6开放阅读框15 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15466855
cacna1a APCA |cacnl1a4 |cav2.1 |EA2 |FHM |HPCA |MHP |MHP1 |SCA6 钙通道，电压依赖性，p/q类型，alpha 1a亚基 - HPRD，Biogrid 9303303
平静1 Calml2 |CAMI |DD132 |PHKD 钙调蛋白1（磷酸化酶激酶，三角洲） 重构的复合物 Biogrid 8901523
CPLX1 CPX-I |CPX1 复合素1 - HPRD 7553862
FGF1 AFGF |ECGF |ECGF-beta |ECGFA |ECGFB |fgf-alpha |fgfa |glio703 |HBGF1 fibroblast growth factor 1 (acidic) - HPRD，Biogrid 11432880
GOLM1 C9orf155 |FLJ22634 |FLJ23608 |Golph2 |gp73 |PSEC0257 |BA379P1.3 高尔基膜蛋白1 Two-hybrid Biogrid 16169070
NRXN1 dkfzp313p2036 |FLJ35941 |HS.22998 |KIAA0578 神经1 - HPRD 8901523|11243866
S100A13 - S100钙结合蛋白A13 - HPRD，Biogrid 9712836|11432880
|12135982
snap25 FLJ23079 |RIC-4 |Ric4 |sec9 |快照|Snap-25 |BA416N4.2 |DJ1068F16.2 突触小体相关蛋白，25KDA - HPRD，Biogrid 10692432
Ston2 STN2 |STNB | STNB2 Stonin 2 - HPRD，Biogrid 11381094|11454741
STX1A HPC-1 |STX1 |P35-1 语法1A（大脑） - HPRD，Biogrid 9010211
STX2 EPIM |EPM |MGC51014 |STX2A |STX2B |STX2C 语法2 重构的复合物 Biogrid 10397765
STX3 STX3A 语法3 重构的复合物 Biogrid 10397765
STX4 STX4A |P35-2 语法4 重构的复合物 Biogrid 10397765
SV2B HST19680 |KIAA0735 突触囊泡糖蛋白2b - HPRD，Biogrid 15466855
SV2C MGC118874 |MGC118875 |MGC118876 |MGC118877 突触囊泡糖蛋白2C 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15466855
合并 GRY-RBP | HNRPQ1 | NSAP1 | RP1-3J17.2 | dJ3J17.2 | hnRNP-Q | pp68 Synaptotagmin结合，细胞质RNA相互作用蛋白 - HPRD，Biogrid 10734137
SYT4 HST1192 |KIAA1342 Synaptotagmin IV - HPRD 10397765
ZDHHC17 HIP14 |hip3 |HSPC294 |Hyph |KIAA0946 锌指，含有17的DHHC型 HIP14催化突触毒素I的棕榈酰化I。这种相互作用是在未指定物种的人类HIP14和突触量I之间的相互作用上建模的。 绑定 15603740


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
SIG CD40Pathwaymap 34 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组肉毒杆菌神经毒性 19 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组谷氨酸神经递质释放周期 15 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
跨化学突触的反应组传播 186 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome神经元系统 279 221 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome神经递质释放周期 34 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组多巴胺神经递质释放周期 11 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组乙酰胆碱神经递质释放周期 10 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组去甲肾上腺素神经递质释放周期 10 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GABA合成释放再摄取和降解 17 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
家长mtor信号向上 567 375 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOOI ST7靶向 94 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Doane乳腺癌ESR1 UP 112 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Provenzani转移 194 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WEI mir34a目标 148 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Koyama Sema3b靶向 292 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼头颈癌B 48 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 83 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHESLER BRAIN HIGHEST EXPRESSION 40 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
莫迪海马后产后 63 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
江是衰老下丘脑DN 40 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
江口大脑皮层DN 54 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 1 528 324 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lein神经元标记 69 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE DN 220 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang LSD1目标DN 39 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 All SZGR 2.0 genes in this pathway
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔内B 172 109 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN 701 446 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 All SZGR 2.0 genes in this pathway
巴索毛毛细胞白血病DN 80 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HAN SATB1 TARGETS UP 395 249 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MCV6 ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 34 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 38 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向低血清 100 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标汇合 567 365 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
IRS1和IRS2的GUO目标 98 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 61 67 1a HSA-LET-7A脑 ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B脑 ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
HSA-LET-7E脑 ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 ugagguaguugugugugugcugu
mir-1/206 449 455 1a HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
miR-128 1681年 1687 M8 HSA-MIR-128a ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128b ucacagugaaccggucuuc
HSA-MIR-128a ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128b ucacagugaaccggucuuc
mir-129-5p 456 462 M8 HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
miR-133 1602 1608 1a HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua
miR-135 1185 1191 1a HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
miR-137 216 223 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-146 1587年 1594年 1A，M8 HSA-MIR-146A ugagaacugaauuccaugggug
HSA-MIR-146B脑 ugagaacugaauuccauaggcu
mir-148/152 1557 1563 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-153 1624年 1630 M8 HSA-MIR-153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir-19 142 149 1A，M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir-193 46 52 1a HSA-MIR-193A AACUGGCCUACAAAGUCCCAG
HSA-MIR-193B aacuggcccucaaagucccgcuuu
MiR-200BC/429 1126 1132 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
hsa - mir - 200 c uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-218 1578年 1584年 1a HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-221/222 1575年 1581 1a hsa-miR-221脑 agcuacauugucugugggggguc
hsa-miR-222脑 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-27 1457 1463 M8 HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-329 1572 1578年 1a HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
mir-34/449 1539年 1545年 1a HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-369-3p 421 427 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
miR-374 421 427 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-381 271 277 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-382 509 516 1A，M8 HSA-MIR-382脑 Gaaguuucgugguggauucg
mir-450 456 462 1a HSA-MIR-450 uuuuugcgauguuccuaaua
miR-496 385 391 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc