基因页：TAC1
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| 基因ID | 6863 |
| 象征 | TAC1 |
| 同义词 | hs.2563 | nk2 | nkna | npk | tac2 |
| 描述 | 旋转金蛋白前体1 |
| 参考 | MIM：162320|HGNC：HGNC：11517|Ensembl：ENSG00000006128|HPRD：08876|Vega：Otthumg00000154069 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q21-Q22 |
| Pascal P值 | 0.49 |
| 胎儿β | -2.229 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16970828 | CHR16 | 72355138 | TAC1 | 6863 | 0.1 | 反式 | ||
| RS11861074 | CHR16 | 72384378 | TAC1 | 6863 | 0.1 | 反式 | ||
| RS16970929 | CHR16 | 72471992 | TAC1 | 6863 | 0.1 | 反式 | ||
| RS16943914 | CHR18 | 25237114 | TAC1 | 6863 | 0.15 | 反式 | ||
| rs10502497 | CHR18 | 25252275 | TAC1 | 6863 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KTI12 | 0.92 | 0.90 |
| PSMD3 | 0.90 | 0.90 |
| rpusd2 | 0.90 | 0.87 |
| mad2l1bp | 0.90 | 0.90 |
| PSMC4 | 0.89 | 0.86 |
| KBTBD4 | 0.89 | 0.89 |
| STX5 | 0.89 | 0.89 |
| Kat5 | 0.89 | 0.89 |
| HPS6 | 0.88 | 0.86 |
| EIF5A | 0.88 | 0.86 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.8 | -0.79 | -0.82 |
| MT-CO2 | -0.79 | -0.79 |
| mt-cyb | -0.79 | -0.81 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.79 |
| AF347015.33 | -0.77 | -0.78 |
| AF347015.15 | -0.77 | -0.81 |
| AF347015.2 | -0.76 | -0.77 |
| AF347015.26 | -0.76 | -0.81 |
| AF347015.27 | -0.76 | -0.79 |
| AF347015.21 | -0.70 | -0.75 |
第三节。基因本体论注释
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0007268 | 突触传输 | IEA | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | - |
| 去：0007218 | 神经肽信号通路 | IEA | 神经递质（GO期限：8） | - |
| GO:0007204 | 胞质钙离子浓度的升高 | 艾达 | 8957234 | |
| 去：0007217 | 旋转金蛋白信号通路 | IEA | - | |
| 去：0009582 | 检测非生物刺激 | 塔斯 | 9482938 | |
| GO:0007320 | 授精 | 塔斯 | 1708336 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 9548509 |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-218 | 229 | 235 | M8 | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| miR-494 | 427 | 434 | 1A，M8 | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |
| miR-96 | 146 | 152 | M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |