基因页：taf4b
概括？
| 基因 | 6875 |
| 象征 | taf4b |
| 同义词 | SPGF13 | TAF2C2 | TAFII105 |
| 描述 | tata-box结合蛋白相关因子4B |
| 参考 | MIM：601689|HGNC：HGNC：11538|ENSEMBL：ENSG00000141384|Vega：Otthumg00000179429 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 18Q11.2 |
| Pascal P值 | 0.234 |
| Sherlock P值 | 0.23 |
| 胎儿β | -2.659 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21755257 | 18 | 23806431 | taf4b | 7.56e-6 | 1.075 | 0.013 | DMG：Wockner_2014 |
| CG07446438 | 18 | 23806228 | taf4b | 6.05e-5 | 0.417 | 0.023 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TMEM102 | 0.71 | 0.59 |
| PVRL2 | 0.66 | 0.68 |
| NPB | 0.64 | 0.50 |
| LTB4R2 | 0.62 | 0.53 |
| FGF11 | 0.60 | 0.50 |
| RAMP2 | 0.59 | 0.61 |
| FAM109B | 0.58 | 0.48 |
| 纳格鲁 | 0.58 | 0.60 |
| CPNE2 | 0.57 | 0.54 |
| SLC38A5 | 0.57 | 0.59 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KRT222P | -0.38 | -0.44 |
| KBTBD3 | -0.38 | -0.49 |
| CCDC25 | -0.38 | -0.43 |
| CDH18 | -0.37 | -0.41 |
| C1orf151 | -0.35 | -0.37 |
| chn1 | -0.35 | -0.30 |
| UQCRB | -0.35 | -0.41 |
| FAM162A | -0.35 | -0.37 |
| snap25 | -0.34 | -0.38 |
| Stambpl1 | -0.34 | -0.43 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg基础转录因子 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol II转录 | 105 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA POL II转录启动和启动子开口 | 41 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol II前转录事件 | 61 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽玛辐射2G后的生存率不佳 | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk早期腹部卵泡 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB DN发出的信号 | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HO肝癌血管侵袭 | 13 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 突变的TP53的Stambolsky靶标 | 49 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |